Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ3

TXNDC2, Thioredoxin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC2Q86VQ3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.87■■■■■ 4.45
TXNDC2Q86VQ3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
TXNDC2Q86VQ3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC42.84■■■■■ 4.45
TXNDC2Q86VQ3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC42.78■■■■■ 4.44
TXNDC2Q86VQ3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC42.76■■■■■ 4.44
TXNDC2Q86VQ3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
TXNDC2Q86VQ3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC42.7■■■■■ 4.43
TXNDC2Q86VQ3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC42.69■■■■■ 4.42
TXNDC2Q86VQ3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC42.68■■■■■ 4.42
TXNDC2Q86VQ3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
TXNDC2Q86VQ3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.63■■■■■ 4.42
TXNDC2Q86VQ3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC42.62■■■■■ 4.41
TXNDC2Q86VQ3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
TXNDC2Q86VQ3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.53■■■■■ 4.4
TXNDC2Q86VQ3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.52■■■■■ 4.4
TXNDC2Q86VQ3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.38
TXNDC2Q86VQ3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
TXNDC2Q86VQ3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC42.39■■■■■ 4.38
TXNDC2Q86VQ3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
TXNDC2Q86VQ3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
TXNDC2Q86VQ3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC42.34■■■■■ 4.37
TXNDC2Q86VQ3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC42.31■■■■■ 4.36
TXNDC2Q86VQ3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC42.27■■■■■ 4.36
TXNDC2Q86VQ3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC42.25■■■■■ 4.35
TXNDC2Q86VQ3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
TXNDC2Q86VQ3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC42.18■■■■■ 4.34
TXNDC2Q86VQ3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC42.17■■■■■ 4.34
TXNDC2Q86VQ3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC42.17■■■■■ 4.34
TXNDC2Q86VQ3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
TXNDC2Q86VQ3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
TXNDC2Q86VQ3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC42.14■■■■■ 4.34
TXNDC2Q86VQ3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.13■■■■■ 4.33
TXNDC2Q86VQ3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC42.13■■■■■ 4.33
TXNDC2Q86VQ3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.33
TXNDC2Q86VQ3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
TXNDC2Q86VQ3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC42.03■■■■■ 4.32
TXNDC2Q86VQ3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
TXNDC2Q86VQ3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
TXNDC2Q86VQ3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
TXNDC2Q86VQ3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC41.97■■■■■ 4.31
TXNDC2Q86VQ3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC41.95■■■■■ 4.31
TXNDC2Q86VQ3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
TXNDC2Q86VQ3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC41.92■■■■■ 4.3
TXNDC2Q86VQ3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
TXNDC2Q86VQ3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
TXNDC2Q86VQ3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.87■■■■■ 4.29
TXNDC2Q86VQ3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
TXNDC2Q86VQ3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC41.87■■■■■ 4.29
TXNDC2Q86VQ3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
TXNDC2Q86VQ3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
TXNDC2Q86VQ3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC41.78■■■■■ 4.28
TXNDC2Q86VQ3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
TXNDC2Q86VQ3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
TXNDC2Q86VQ3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC41.77■■■■■ 4.28
TXNDC2Q86VQ3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
TXNDC2Q86VQ3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC41.7■■■■■ 4.27
TXNDC2Q86VQ3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.67■■■■■ 4.26
TXNDC2Q86VQ3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC41.65■■■■■ 4.26
TXNDC2Q86VQ3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
TXNDC2Q86VQ3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
TXNDC2Q86VQ3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
TXNDC2Q86VQ3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC41.49■■■■■ 4.23
TXNDC2Q86VQ3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC41.48■■■■■ 4.23
TXNDC2Q86VQ3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.47■■■■■ 4.23
TXNDC2Q86VQ3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC41.45■■■■■ 4.23
TXNDC2Q86VQ3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
TXNDC2Q86VQ3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC41.43■■■■■ 4.22
TXNDC2Q86VQ3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
TXNDC2Q86VQ3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC41.39■■■■■ 4.22
TXNDC2Q86VQ3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
TXNDC2Q86VQ3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
TXNDC2Q86VQ3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
TXNDC2Q86VQ3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
TXNDC2Q86VQ3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
TXNDC2Q86VQ3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.2
TXNDC2Q86VQ3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC41.26■■■■■ 4.2
TXNDC2Q86VQ3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC41.26■■■■■ 4.2
TXNDC2Q86VQ3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
TXNDC2Q86VQ3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.24■■■■■ 4.19
TXNDC2Q86VQ3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
TXNDC2Q86VQ3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
TXNDC2Q86VQ3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
TXNDC2Q86VQ3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
TXNDC2Q86VQ3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
TXNDC2Q86VQ3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
TXNDC2Q86VQ3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
TXNDC2Q86VQ3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC41.16■■■■■ 4.18
TXNDC2Q86VQ3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC41.15■■■■■ 4.18
TXNDC2Q86VQ3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
TXNDC2Q86VQ3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC41.15■■■■■ 4.18
TXNDC2Q86VQ3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
TXNDC2Q86VQ3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
TXNDC2Q86VQ3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.12■■■■■ 4.17
TXNDC2Q86VQ3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC41.11■■■■■ 4.17
TXNDC2Q86VQ3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
TXNDC2Q86VQ3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC41.1■■■■■ 4.17
TXNDC2Q86VQ3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
TXNDC2Q86VQ3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
TXNDC2Q86VQ3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
TXNDC2Q86VQ3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC40.97■■■■■ 4.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms