Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPR3

RPTN, Repetin, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPTNQ6XPR3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPTNQ6XPR3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RPTNQ6XPR3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RPTNQ6XPR3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RPTNQ6XPR3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RPTNQ6XPR3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RPTNQ6XPR3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RPTNQ6XPR3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RPTNQ6XPR3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPTNQ6XPR3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPTNQ6XPR3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPTNQ6XPR3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPTNQ6XPR3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPTNQ6XPR3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPTNQ6XPR3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPTNQ6XPR3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPTNQ6XPR3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
RPTNQ6XPR3 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPTNQ6XPR3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPTNQ6XPR3 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPTNQ6XPR3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPTNQ6XPR3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPTNQ6XPR3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
RPTNQ6XPR3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
RPTNQ6XPR3 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
RPTNQ6XPR3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RPTNQ6XPR3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
RPTNQ6XPR3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPTNQ6XPR3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RPTNQ6XPR3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RPTNQ6XPR3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RPTNQ6XPR3 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RPTNQ6XPR3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RPTNQ6XPR3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RPTNQ6XPR3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RPTNQ6XPR3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPTNQ6XPR3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPTNQ6XPR3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RPTNQ6XPR3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RPTNQ6XPR3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RPTNQ6XPR3 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RPTNQ6XPR3 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RPTNQ6XPR3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPTNQ6XPR3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPTNQ6XPR3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RPTNQ6XPR3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RPTNQ6XPR3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RPTNQ6XPR3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RPTNQ6XPR3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPTNQ6XPR3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPTNQ6XPR3 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPTNQ6XPR3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPTNQ6XPR3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RPTNQ6XPR3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RPTNQ6XPR3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RPTNQ6XPR3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPTNQ6XPR3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RPTNQ6XPR3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPTNQ6XPR3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPTNQ6XPR3 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPTNQ6XPR3 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RPTNQ6XPR3 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RPTNQ6XPR3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RPTNQ6XPR3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RPTNQ6XPR3 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RPTNQ6XPR3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPTNQ6XPR3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RPTNQ6XPR3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RPTNQ6XPR3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPTNQ6XPR3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RPTNQ6XPR3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RPTNQ6XPR3 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPTNQ6XPR3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPTNQ6XPR3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPTNQ6XPR3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RPTNQ6XPR3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPTNQ6XPR3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RPTNQ6XPR3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPTNQ6XPR3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RPTNQ6XPR3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPTNQ6XPR3 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPTNQ6XPR3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RPTNQ6XPR3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RPTNQ6XPR3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RPTNQ6XPR3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RPTNQ6XPR3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPTNQ6XPR3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPTNQ6XPR3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPTNQ6XPR3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPTNQ6XPR3 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPTNQ6XPR3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPTNQ6XPR3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPTNQ6XPR3 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPTNQ6XPR3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPTNQ6XPR3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RPTNQ6XPR3 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPTNQ6XPR3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPTNQ6XPR3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPTNQ6XPR3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPTNQ6XPR3 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms