Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
HRCT1Q6UXD1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HRCT1Q6UXD1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HRCT1Q6UXD1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HRCT1Q6UXD1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HRCT1Q6UXD1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
HRCT1Q6UXD1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
HRCT1Q6UXD1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
HRCT1Q6UXD1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
HRCT1Q6UXD1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
HRCT1Q6UXD1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HRCT1Q6UXD1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
HRCT1Q6UXD1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
HRCT1Q6UXD1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
HRCT1Q6UXD1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
HRCT1Q6UXD1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
HRCT1Q6UXD1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
HRCT1Q6UXD1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HRCT1Q6UXD1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
HRCT1Q6UXD1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HRCT1Q6UXD1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
HRCT1Q6UXD1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
HRCT1Q6UXD1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
HRCT1Q6UXD1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HRCT1Q6UXD1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HRCT1Q6UXD1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HRCT1Q6UXD1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HRCT1Q6UXD1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HRCT1Q6UXD1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HRCT1Q6UXD1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HRCT1Q6UXD1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HRCT1Q6UXD1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HRCT1Q6UXD1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HRCT1Q6UXD1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
HRCT1Q6UXD1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
HRCT1Q6UXD1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
HRCT1Q6UXD1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HRCT1Q6UXD1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HRCT1Q6UXD1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HRCT1Q6UXD1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HRCT1Q6UXD1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HRCT1Q6UXD1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HRCT1Q6UXD1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HRCT1Q6UXD1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HRCT1Q6UXD1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HRCT1Q6UXD1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HRCT1Q6UXD1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HRCT1Q6UXD1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
HRCT1Q6UXD1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HRCT1Q6UXD1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HRCT1Q6UXD1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
HRCT1Q6UXD1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
HRCT1Q6UXD1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
HRCT1Q6UXD1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
HRCT1Q6UXD1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HRCT1Q6UXD1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
HRCT1Q6UXD1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HRCT1Q6UXD1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HRCT1Q6UXD1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HRCT1Q6UXD1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HRCT1Q6UXD1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HRCT1Q6UXD1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HRCT1Q6UXD1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HRCT1Q6UXD1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HRCT1Q6UXD1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
HRCT1Q6UXD1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
HRCT1Q6UXD1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HRCT1Q6UXD1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
HRCT1Q6UXD1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
HRCT1Q6UXD1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HRCT1Q6UXD1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
HRCT1Q6UXD1 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
HRCT1Q6UXD1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HRCT1Q6UXD1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HRCT1Q6UXD1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
HRCT1Q6UXD1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
HRCT1Q6UXD1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HRCT1Q6UXD1 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
HRCT1Q6UXD1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
HRCT1Q6UXD1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HRCT1Q6UXD1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
HRCT1Q6UXD1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HRCT1Q6UXD1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
HRCT1Q6UXD1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
HRCT1Q6UXD1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
HRCT1Q6UXD1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HRCT1Q6UXD1 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HRCT1Q6UXD1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
HRCT1Q6UXD1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HRCT1Q6UXD1 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
HRCT1Q6UXD1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HRCT1Q6UXD1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HRCT1Q6UXD1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
HRCT1Q6UXD1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
HRCT1Q6UXD1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HRCT1Q6UXD1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
HRCT1Q6UXD1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HRCT1Q6UXD1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
HRCT1Q6UXD1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HRCT1Q6UXD1 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms