Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
PRPF40BQ6NWY9 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
PRPF40BQ6NWY9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PRPF40BQ6NWY9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PRPF40BQ6NWY9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PRPF40BQ6NWY9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
PRPF40BQ6NWY9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
PRPF40BQ6NWY9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PRPF40BQ6NWY9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PRPF40BQ6NWY9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PRPF40BQ6NWY9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PRPF40BQ6NWY9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
PRPF40BQ6NWY9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PRPF40BQ6NWY9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PRPF40BQ6NWY9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PRPF40BQ6NWY9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
PRPF40BQ6NWY9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PRPF40BQ6NWY9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PRPF40BQ6NWY9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PRPF40BQ6NWY9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
PRPF40BQ6NWY9 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
PRPF40BQ6NWY9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
PRPF40BQ6NWY9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC36.53■■■■□ 3.44
PRPF40BQ6NWY9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PRPF40BQ6NWY9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
PRPF40BQ6NWY9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.43
PRPF40BQ6NWY9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PRPF40BQ6NWY9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PRPF40BQ6NWY9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PRPF40BQ6NWY9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PRPF40BQ6NWY9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
PRPF40BQ6NWY9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
PRPF40BQ6NWY9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
PRPF40BQ6NWY9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
PRPF40BQ6NWY9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC36.19■■■■□ 3.38
PRPF40BQ6NWY9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
PRPF40BQ6NWY9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
PRPF40BQ6NWY9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
PRPF40BQ6NWY9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
PRPF40BQ6NWY9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
PRPF40BQ6NWY9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PRPF40BQ6NWY9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
PRPF40BQ6NWY9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
PRPF40BQ6NWY9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
PRPF40BQ6NWY9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
PRPF40BQ6NWY9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
PRPF40BQ6NWY9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
PRPF40BQ6NWY9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
PRPF40BQ6NWY9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
PRPF40BQ6NWY9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC35.98■■■■□ 3.35
PRPF40BQ6NWY9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
PRPF40BQ6NWY9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
PRPF40BQ6NWY9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC35.95■■■■□ 3.35
PRPF40BQ6NWY9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
PRPF40BQ6NWY9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
PRPF40BQ6NWY9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
PRPF40BQ6NWY9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
PRPF40BQ6NWY9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
PRPF40BQ6NWY9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PRPF40BQ6NWY9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PRPF40BQ6NWY9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
PRPF40BQ6NWY9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PRPF40BQ6NWY9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
PRPF40BQ6NWY9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
PRPF40BQ6NWY9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
PRPF40BQ6NWY9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PRPF40BQ6NWY9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
PRPF40BQ6NWY9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
PRPF40BQ6NWY9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
PRPF40BQ6NWY9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
PRPF40BQ6NWY9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
PRPF40BQ6NWY9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
PRPF40BQ6NWY9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
PRPF40BQ6NWY9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
PRPF40BQ6NWY9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
PRPF40BQ6NWY9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PRPF40BQ6NWY9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
PRPF40BQ6NWY9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
PRPF40BQ6NWY9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
PRPF40BQ6NWY9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
PRPF40BQ6NWY9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
PRPF40BQ6NWY9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
PRPF40BQ6NWY9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
PRPF40BQ6NWY9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
PRPF40BQ6NWY9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
PRPF40BQ6NWY9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
PRPF40BQ6NWY9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
PRPF40BQ6NWY9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
PRPF40BQ6NWY9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
PRPF40BQ6NWY9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
PRPF40BQ6NWY9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
PRPF40BQ6NWY9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
PRPF40BQ6NWY9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PRPF40BQ6NWY9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
PRPF40BQ6NWY9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PRPF40BQ6NWY9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
PRPF40BQ6NWY9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
PRPF40BQ6NWY9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PRPF40BQ6NWY9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
PRPF40BQ6NWY9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms