Protein–RNA interactions for Protein: Q5TH69

ARFGEF3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 2,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF3Q5TH69 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARFGEF3Q5TH69 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFGEF3Q5TH69 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARFGEF3Q5TH69 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARFGEF3Q5TH69 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARFGEF3Q5TH69 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARFGEF3Q5TH69 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARFGEF3Q5TH69 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ARFGEF3Q5TH69 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARFGEF3Q5TH69 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARFGEF3Q5TH69 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARFGEF3Q5TH69 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARFGEF3Q5TH69 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ARFGEF3Q5TH69 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARFGEF3Q5TH69 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARFGEF3Q5TH69 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARFGEF3Q5TH69 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ARFGEF3Q5TH69 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARFGEF3Q5TH69 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARFGEF3Q5TH69 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARFGEF3Q5TH69 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARFGEF3Q5TH69 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARFGEF3Q5TH69 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARFGEF3Q5TH69 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARFGEF3Q5TH69 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARFGEF3Q5TH69 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARFGEF3Q5TH69 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARFGEF3Q5TH69 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARFGEF3Q5TH69 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ARFGEF3Q5TH69 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARFGEF3Q5TH69 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ARFGEF3Q5TH69 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARFGEF3Q5TH69 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARFGEF3Q5TH69 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARFGEF3Q5TH69 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARFGEF3Q5TH69 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ARFGEF3Q5TH69 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARFGEF3Q5TH69 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARFGEF3Q5TH69 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARFGEF3Q5TH69 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARFGEF3Q5TH69 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARFGEF3Q5TH69 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARFGEF3Q5TH69 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARFGEF3Q5TH69 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARFGEF3Q5TH69 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ARFGEF3Q5TH69 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARFGEF3Q5TH69 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARFGEF3Q5TH69 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARFGEF3Q5TH69 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARFGEF3Q5TH69 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARFGEF3Q5TH69 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARFGEF3Q5TH69 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF3Q5TH69 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARFGEF3Q5TH69 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGEF3Q5TH69 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFGEF3Q5TH69 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARFGEF3Q5TH69 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFGEF3Q5TH69 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFGEF3Q5TH69 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARFGEF3Q5TH69 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARFGEF3Q5TH69 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARFGEF3Q5TH69 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARFGEF3Q5TH69 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFGEF3Q5TH69 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFGEF3Q5TH69 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFGEF3Q5TH69 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFGEF3Q5TH69 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFGEF3Q5TH69 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFGEF3Q5TH69 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFGEF3Q5TH69 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFGEF3Q5TH69 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGEF3Q5TH69 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGEF3Q5TH69 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFGEF3Q5TH69 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFGEF3Q5TH69 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGEF3Q5TH69 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFGEF3Q5TH69 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGEF3Q5TH69 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGEF3Q5TH69 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGEF3Q5TH69 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFGEF3Q5TH69 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARFGEF3Q5TH69 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARFGEF3Q5TH69 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
ARFGEF3Q5TH69 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARFGEF3Q5TH69 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARFGEF3Q5TH69 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARFGEF3Q5TH69 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ARFGEF3Q5TH69 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ARFGEF3Q5TH69 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ARFGEF3Q5TH69 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ARFGEF3Q5TH69 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARFGEF3Q5TH69 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ARFGEF3Q5TH69 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARFGEF3Q5TH69 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARFGEF3Q5TH69 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARFGEF3Q5TH69 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARFGEF3Q5TH69 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARFGEF3Q5TH69 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARFGEF3Q5TH69 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARFGEF3Q5TH69 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms