Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZFHX3Q15911 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZFHX3Q15911 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZFHX3Q15911 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZFHX3Q15911 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ZFHX3Q15911 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZFHX3Q15911 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZFHX3Q15911 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ZFHX3Q15911 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZFHX3Q15911 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZFHX3Q15911 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZFHX3Q15911 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZFHX3Q15911 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZFHX3Q15911 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZFHX3Q15911 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZFHX3Q15911 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZFHX3Q15911 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZFHX3Q15911 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZFHX3Q15911 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZFHX3Q15911 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ZFHX3Q15911 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ZFHX3Q15911 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZFHX3Q15911 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZFHX3Q15911 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZFHX3Q15911 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZFHX3Q15911 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZFHX3Q15911 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZFHX3Q15911 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZFHX3Q15911 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ZFHX3Q15911 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZFHX3Q15911 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZFHX3Q15911 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZFHX3Q15911 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZFHX3Q15911 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZFHX3Q15911 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZFHX3Q15911 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZFHX3Q15911 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZFHX3Q15911 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZFHX3Q15911 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFHX3Q15911 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZFHX3Q15911 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZFHX3Q15911 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZFHX3Q15911 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZFHX3Q15911 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZFHX3Q15911 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZFHX3Q15911 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZFHX3Q15911 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZFHX3Q15911 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZFHX3Q15911 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZFHX3Q15911 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZFHX3Q15911 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZFHX3Q15911 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZFHX3Q15911 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZFHX3Q15911 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZFHX3Q15911 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZFHX3Q15911 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZFHX3Q15911 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZFHX3Q15911 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZFHX3Q15911 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZFHX3Q15911 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZFHX3Q15911 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZFHX3Q15911 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZFHX3Q15911 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZFHX3Q15911 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZFHX3Q15911 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZFHX3Q15911 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZFHX3Q15911 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZFHX3Q15911 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZFHX3Q15911 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZFHX3Q15911 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZFHX3Q15911 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZFHX3Q15911 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ZFHX3Q15911 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ZFHX3Q15911 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ZFHX3Q15911 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZFHX3Q15911 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ZFHX3Q15911 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ZFHX3Q15911 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZFHX3Q15911 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ZFHX3Q15911 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZFHX3Q15911 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZFHX3Q15911 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZFHX3Q15911 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ZFHX3Q15911 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZFHX3Q15911 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZFHX3Q15911 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZFHX3Q15911 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ZFHX3Q15911 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZFHX3Q15911 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZFHX3Q15911 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZFHX3Q15911 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZFHX3Q15911 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZFHX3Q15911 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZFHX3Q15911 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZFHX3Q15911 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZFHX3Q15911 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZFHX3Q15911 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZFHX3Q15911 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZFHX3Q15911 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZFHX3Q15911 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
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