Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CCDC85BQ15834 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CCDC85BQ15834 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
CCDC85BQ15834 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CCDC85BQ15834 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CCDC85BQ15834 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
CCDC85BQ15834 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CCDC85BQ15834 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
CCDC85BQ15834 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CCDC85BQ15834 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CCDC85BQ15834 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CCDC85BQ15834 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CCDC85BQ15834 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CCDC85BQ15834 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC31.44■■■□□ 2.62
CCDC85BQ15834 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
CCDC85BQ15834 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC85BQ15834 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CCDC85BQ15834 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CCDC85BQ15834 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
CCDC85BQ15834 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
CCDC85BQ15834 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CCDC85BQ15834 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC85BQ15834 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
CCDC85BQ15834 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC85BQ15834 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CCDC85BQ15834 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CCDC85BQ15834 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CCDC85BQ15834 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CCDC85BQ15834 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CCDC85BQ15834 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC85BQ15834 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
CCDC85BQ15834 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CCDC85BQ15834 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CCDC85BQ15834 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
CCDC85BQ15834 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CCDC85BQ15834 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC85BQ15834 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC85BQ15834 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
CCDC85BQ15834 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
CCDC85BQ15834 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC85BQ15834 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC85BQ15834 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CCDC85BQ15834 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
CCDC85BQ15834 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
CCDC85BQ15834 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC85BQ15834 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CCDC85BQ15834 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC85BQ15834 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
CCDC85BQ15834 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC85BQ15834 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CCDC85BQ15834 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CCDC85BQ15834 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
CCDC85BQ15834 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CCDC85BQ15834 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CCDC85BQ15834 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
CCDC85BQ15834 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
CCDC85BQ15834 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CCDC85BQ15834 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC85BQ15834 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
CCDC85BQ15834 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC85BQ15834 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
CCDC85BQ15834 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CCDC85BQ15834 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
CCDC85BQ15834 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
CCDC85BQ15834 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CCDC85BQ15834 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CCDC85BQ15834 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC85BQ15834 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
CCDC85BQ15834 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
CCDC85BQ15834 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC85BQ15834 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
CCDC85BQ15834 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CCDC85BQ15834 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CCDC85BQ15834 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC85BQ15834 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC85BQ15834 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC85BQ15834 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC85BQ15834 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC85BQ15834 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC85BQ15834 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC85BQ15834 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC85BQ15834 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC85BQ15834 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC85BQ15834 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC85BQ15834 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CCDC85BQ15834 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC85BQ15834 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC85BQ15834 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC85BQ15834 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC85BQ15834 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC85BQ15834 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CCDC85BQ15834 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC85BQ15834 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
CCDC85BQ15834 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC85BQ15834 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC85BQ15834 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC85BQ15834 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC85BQ15834 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC85BQ15834 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
CCDC85BQ15834 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
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