Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC44.19■■■■■ 4.66
NCOA1Q15788 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
NCOA1Q15788 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.11■■■■■ 4.65
NCOA1Q15788 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC44.1■■■■■ 4.65
NCOA1Q15788 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC44.1■■■■■ 4.65
NCOA1Q15788 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.09■■■■■ 4.65
NCOA1Q15788 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
NCOA1Q15788 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC44.06■■■■■ 4.64
NCOA1Q15788 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.05■■■■■ 4.64
NCOA1Q15788 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
NCOA1Q15788 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC44.02■■■■■ 4.64
NCOA1Q15788 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC44.02■■■■■ 4.64
NCOA1Q15788 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC44.01■■■■■ 4.64
NCOA1Q15788 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC44■■■■■ 4.63
NCOA1Q15788 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC44■■■■■ 4.63
NCOA1Q15788 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.94■■■■■ 4.62
NCOA1Q15788 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
NCOA1Q15788 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.91■■■■■ 4.62
NCOA1Q15788 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC43.9■■■■■ 4.62
NCOA1Q15788 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
NCOA1Q15788 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC43.85■■■■■ 4.61
NCOA1Q15788 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
NCOA1Q15788 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC43.82■■■■■ 4.6
NCOA1Q15788 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
NCOA1Q15788 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC43.77■■■■■ 4.6
NCOA1Q15788 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC43.77■■■■■ 4.6
NCOA1Q15788 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
NCOA1Q15788 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
NCOA1Q15788 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
NCOA1Q15788 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
NCOA1Q15788 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC43.66■■■■■ 4.58
NCOA1Q15788 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
NCOA1Q15788 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC43.62■■■■■ 4.57
NCOA1Q15788 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC43.59■■■■■ 4.57
NCOA1Q15788 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
NCOA1Q15788 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
NCOA1Q15788 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC43.49■■■■■ 4.55
NCOA1Q15788 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.48■■■■■ 4.55
NCOA1Q15788 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC43.45■■■■■ 4.55
NCOA1Q15788 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC43.43■■■■■ 4.54
NCOA1Q15788 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC43.36■■■■■ 4.53
NCOA1Q15788 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
NCOA1Q15788 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
NCOA1Q15788 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
NCOA1Q15788 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC43.3■■■■■ 4.52
NCOA1Q15788 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC43.3■■■■■ 4.52
NCOA1Q15788 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
NCOA1Q15788 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC43.25■■■■■ 4.51
NCOA1Q15788 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
NCOA1Q15788 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC43.18■■■■■ 4.5
NCOA1Q15788 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
NCOA1Q15788 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC43.13■■■■■ 4.49
NCOA1Q15788 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
NCOA1Q15788 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
NCOA1Q15788 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC43.09■■■■■ 4.49
NCOA1Q15788 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC43.02■■■■■ 4.48
NCOA1Q15788 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
NCOA1Q15788 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC42.97■■■■■ 4.47
NCOA1Q15788 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
NCOA1Q15788 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC42.96■■■■■ 4.47
NCOA1Q15788 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC42.95■■■■■ 4.47
NCOA1Q15788 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC42.94■■■■■ 4.46
NCOA1Q15788 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.92■■■■■ 4.46
NCOA1Q15788 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
NCOA1Q15788 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC42.89■■■■■ 4.46
NCOA1Q15788 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.46
NCOA1Q15788 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC42.88■■■■■ 4.45
NCOA1Q15788 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
NCOA1Q15788 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
NCOA1Q15788 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.84■■■■■ 4.45
NCOA1Q15788 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC42.84■■■■■ 4.45
NCOA1Q15788 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
NCOA1Q15788 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC42.83■■■■■ 4.45
NCOA1Q15788 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
NCOA1Q15788 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
NCOA1Q15788 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
NCOA1Q15788 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC42.77■■■■■ 4.44
NCOA1Q15788 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC42.76■■■■■ 4.44
NCOA1Q15788 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC42.75■■■■■ 4.43
NCOA1Q15788 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC42.71■■■■■ 4.43
NCOA1Q15788 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
NCOA1Q15788 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
NCOA1Q15788 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC42.66■■■■■ 4.42
NCOA1Q15788 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
NCOA1Q15788 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
NCOA1Q15788 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
NCOA1Q15788 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.62■■■■■ 4.41
NCOA1Q15788 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
NCOA1Q15788 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC42.57■■■■■ 4.41
NCOA1Q15788 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC42.57■■■■■ 4.41
NCOA1Q15788 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
NCOA1Q15788 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
NCOA1Q15788 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC42.52■■■■■ 4.4
NCOA1Q15788 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC42.47■■■■■ 4.39
NCOA1Q15788 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC42.47■■■■■ 4.39
NCOA1Q15788 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
NCOA1Q15788 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
NCOA1Q15788 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
NCOA1Q15788 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.38
NCOA1Q15788 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
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