Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC42.31■■■■■ 4.36
NWD1Q149M9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
NWD1Q149M9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
NWD1Q149M9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.27■■■■■ 4.36
NWD1Q149M9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC42.26■■■■■ 4.36
NWD1Q149M9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
NWD1Q149M9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC42.16■■■■■ 4.34
NWD1Q149M9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC42.15■■■■■ 4.34
NWD1Q149M9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC42.05■■■■■ 4.32
NWD1Q149M9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
NWD1Q149M9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC41.97■■■■■ 4.31
NWD1Q149M9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC41.95■■■■■ 4.31
NWD1Q149M9 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC41.93■■■■■ 4.3
NWD1Q149M9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
NWD1Q149M9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.87■■■■■ 4.29
NWD1Q149M9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.83■■■■■ 4.29
NWD1Q149M9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
NWD1Q149M9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC41.8■■■■■ 4.28
NWD1Q149M9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC41.76■■■■■ 4.28
NWD1Q149M9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
NWD1Q149M9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC41.71■■■■■ 4.27
NWD1Q149M9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
NWD1Q149M9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
NWD1Q149M9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC41.62■■■■■ 4.25
NWD1Q149M9 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
NWD1Q149M9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
NWD1Q149M9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
NWD1Q149M9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
NWD1Q149M9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
NWD1Q149M9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
NWD1Q149M9 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
NWD1Q149M9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.49■■■■■ 4.23
NWD1Q149M9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
NWD1Q149M9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC41.44■■■■■ 4.23
NWD1Q149M9 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
NWD1Q149M9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
NWD1Q149M9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
NWD1Q149M9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
NWD1Q149M9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC41.38■■■■■ 4.22
NWD1Q149M9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
NWD1Q149M9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
NWD1Q149M9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC41.33■■■■■ 4.21
NWD1Q149M9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC41.33■■■■■ 4.21
NWD1Q149M9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
NWD1Q149M9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC41.3■■■■■ 4.2
NWD1Q149M9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC41.25■■■■■ 4.19
NWD1Q149M9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
NWD1Q149M9 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC41.21■■■■■ 4.19
NWD1Q149M9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
NWD1Q149M9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.2■■■■■ 4.19
NWD1Q149M9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC41.2■■■■■ 4.19
NWD1Q149M9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC41.17■■■■■ 4.18
NWD1Q149M9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
NWD1Q149M9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.18
NWD1Q149M9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
NWD1Q149M9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC41.09■■■■■ 4.17
NWD1Q149M9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
NWD1Q149M9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC41.01■■■■■ 4.16
NWD1Q149M9 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
NWD1Q149M9 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
NWD1Q149M9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
NWD1Q149M9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
NWD1Q149M9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC40.91■■■■■ 4.14
NWD1Q149M9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
NWD1Q149M9 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.86■■■■■ 4.13
NWD1Q149M9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
NWD1Q149M9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC40.84■■■■■ 4.13
NWD1Q149M9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
NWD1Q149M9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC40.78■■■■■ 4.12
NWD1Q149M9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
NWD1Q149M9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
NWD1Q149M9 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
NWD1Q149M9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
NWD1Q149M9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
NWD1Q149M9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC40.68■■■■■ 4.1
NWD1Q149M9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
NWD1Q149M9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
NWD1Q149M9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
NWD1Q149M9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
NWD1Q149M9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC40.64■■■■■ 4.1
NWD1Q149M9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
NWD1Q149M9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
NWD1Q149M9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
NWD1Q149M9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
NWD1Q149M9 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
NWD1Q149M9 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
NWD1Q149M9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
NWD1Q149M9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
NWD1Q149M9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
NWD1Q149M9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
NWD1Q149M9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
NWD1Q149M9 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC40.46■■■■■ 4.07
NWD1Q149M9 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
NWD1Q149M9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
NWD1Q149M9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
NWD1Q149M9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
NWD1Q149M9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
NWD1Q149M9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC40.41■■■■■ 4.06
NWD1Q149M9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
NWD1Q149M9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
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