Protein–RNA interactions for Protein: Q14088

RAB33A, Ras-related protein Rab-33A, humanhuman

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB33AQ14088 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RAB33AQ14088 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RAB33AQ14088 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
RAB33AQ14088 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
RAB33AQ14088 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
RAB33AQ14088 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
RAB33AQ14088 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
RAB33AQ14088 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
RAB33AQ14088 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RAB33AQ14088 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RAB33AQ14088 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RAB33AQ14088 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RAB33AQ14088 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RAB33AQ14088 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RAB33AQ14088 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RAB33AQ14088 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RAB33AQ14088 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
RAB33AQ14088 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
RAB33AQ14088 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
RAB33AQ14088 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RAB33AQ14088 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RAB33AQ14088 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RAB33AQ14088 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RAB33AQ14088 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RAB33AQ14088 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RAB33AQ14088 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RAB33AQ14088 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RAB33AQ14088 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RAB33AQ14088 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
RAB33AQ14088 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
RAB33AQ14088 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
RAB33AQ14088 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RAB33AQ14088 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
RAB33AQ14088 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
RAB33AQ14088 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RAB33AQ14088 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RAB33AQ14088 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RAB33AQ14088 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RAB33AQ14088 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RAB33AQ14088 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RAB33AQ14088 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RAB33AQ14088 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RAB33AQ14088 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RAB33AQ14088 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
RAB33AQ14088 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RAB33AQ14088 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RAB33AQ14088 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
RAB33AQ14088 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
RAB33AQ14088 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
RAB33AQ14088 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RAB33AQ14088 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RAB33AQ14088 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RAB33AQ14088 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
RAB33AQ14088 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RAB33AQ14088 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RAB33AQ14088 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
RAB33AQ14088 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RAB33AQ14088 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RAB33AQ14088 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
RAB33AQ14088 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RAB33AQ14088 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RAB33AQ14088 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
RAB33AQ14088 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
RAB33AQ14088 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RAB33AQ14088 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RAB33AQ14088 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RAB33AQ14088 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RAB33AQ14088 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
RAB33AQ14088 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
RAB33AQ14088 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RAB33AQ14088 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RAB33AQ14088 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RAB33AQ14088 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RAB33AQ14088 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RAB33AQ14088 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
RAB33AQ14088 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RAB33AQ14088 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RAB33AQ14088 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
RAB33AQ14088 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RAB33AQ14088 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
RAB33AQ14088 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RAB33AQ14088 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RAB33AQ14088 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
RAB33AQ14088 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RAB33AQ14088 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RAB33AQ14088 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
RAB33AQ14088 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RAB33AQ14088 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
RAB33AQ14088 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
RAB33AQ14088 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RAB33AQ14088 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
RAB33AQ14088 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RAB33AQ14088 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
RAB33AQ14088 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
RAB33AQ14088 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
RAB33AQ14088 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RAB33AQ14088 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
RAB33AQ14088 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
RAB33AQ14088 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
RAB33AQ14088 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
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