Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC48.59■■■■■ 5.37
SHROOM2Q13796 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.59■■■■■ 5.37
SHROOM2Q13796 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC48.59■■■■■ 5.37
SHROOM2Q13796 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.58■■■■■ 5.37
SHROOM2Q13796 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.56■■■■■ 5.36
SHROOM2Q13796 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.48■■■■■ 5.35
SHROOM2Q13796 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC48.48■■■■■ 5.35
SHROOM2Q13796 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC48.41■■■■■ 5.34
SHROOM2Q13796 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC48.4■■■■■ 5.34
SHROOM2Q13796 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC48.29■■■■■ 5.32
SHROOM2Q13796 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC48.2■■■■■ 5.31
SHROOM2Q13796 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC48.12■■■■■ 5.29
SHROOM2Q13796 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.1■■■■■ 5.29
SHROOM2Q13796 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC48.07■■■■■ 5.29
SHROOM2Q13796 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC47.96■■■■■ 5.27
SHROOM2Q13796 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.95■■■■■ 5.27
SHROOM2Q13796 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.94■■■■■ 5.27
SHROOM2Q13796 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC47.93■■■■■ 5.26
SHROOM2Q13796 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC47.92■■■■■ 5.26
SHROOM2Q13796 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.91■■■■■ 5.26
SHROOM2Q13796 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC47.88■■■■■ 5.25
SHROOM2Q13796 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.85■■■■■ 5.25
SHROOM2Q13796 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC47.78■■■■■ 5.24
SHROOM2Q13796 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.75■■■■■ 5.23
SHROOM2Q13796 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.72■■■■■ 5.23
SHROOM2Q13796 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC47.71■■■■■ 5.23
SHROOM2Q13796 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.7■■■■■ 5.23
SHROOM2Q13796 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.7■■■■■ 5.23
SHROOM2Q13796 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.63■■■■■ 5.22
SHROOM2Q13796 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC47.63■■■■■ 5.22
SHROOM2Q13796 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.63■■■■■ 5.22
SHROOM2Q13796 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC47.59■■■■■ 5.21
SHROOM2Q13796 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.58■■■■■ 5.21
SHROOM2Q13796 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.55■■■■■ 5.2
SHROOM2Q13796 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.5■■■■■ 5.19
SHROOM2Q13796 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC47.5■■■■■ 5.19
SHROOM2Q13796 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC47.49■■■■■ 5.19
SHROOM2Q13796 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC47.47■■■■■ 5.19
SHROOM2Q13796 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC47.45■■■■■ 5.19
SHROOM2Q13796 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.43■■■■■ 5.18
SHROOM2Q13796 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.43■■■■■ 5.18
SHROOM2Q13796 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC47.4■■■■■ 5.18
SHROOM2Q13796 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.36■■■■■ 5.17
SHROOM2Q13796 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47.36■■■■■ 5.17
SHROOM2Q13796 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC47.34■■■■■ 5.17
SHROOM2Q13796 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC47.33■■■■■ 5.17
SHROOM2Q13796 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC47.32■■■■■ 5.17
SHROOM2Q13796 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC47.31■■■■■ 5.16
SHROOM2Q13796 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC47.3■■■■■ 5.16
SHROOM2Q13796 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC47.28■■■■■ 5.16
SHROOM2Q13796 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC47.27■■■■■ 5.16
SHROOM2Q13796 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC47.23■■■■■ 5.15
SHROOM2Q13796 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
SHROOM2Q13796 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.1■■■■■ 5.13
SHROOM2Q13796 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC47.09■■■■■ 5.13
SHROOM2Q13796 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.08■■■■■ 5.13
SHROOM2Q13796 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.07■■■■■ 5.13
SHROOM2Q13796 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC47.06■■■■■ 5.12
SHROOM2Q13796 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC47.05■■■■■ 5.12
SHROOM2Q13796 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC47.05■■■■■ 5.12
SHROOM2Q13796 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC46.98■■■■■ 5.11
SHROOM2Q13796 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.94■■■■■ 5.1
SHROOM2Q13796 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC46.9■■■■■ 5.1
SHROOM2Q13796 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.1
SHROOM2Q13796 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.87■■■■■ 5.09
SHROOM2Q13796 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.85■■■■■ 5.09
SHROOM2Q13796 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC46.84■■■■■ 5.09
SHROOM2Q13796 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC46.83■■■■■ 5.09
SHROOM2Q13796 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.82■■■■■ 5.09
SHROOM2Q13796 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.79■■■■■ 5.08
SHROOM2Q13796 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.76■■■■■ 5.08
SHROOM2Q13796 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC46.76■■■■■ 5.08
SHROOM2Q13796 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.74■■■■■ 5.07
SHROOM2Q13796 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.74■■■■■ 5.07
SHROOM2Q13796 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC46.73■■■■■ 5.07
SHROOM2Q13796 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC46.69■■■■■ 5.06
SHROOM2Q13796 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
SHROOM2Q13796 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
SHROOM2Q13796 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC46.66■■■■■ 5.06
SHROOM2Q13796 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
SHROOM2Q13796 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC46.64■■■■■ 5.06
SHROOM2Q13796 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
SHROOM2Q13796 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
SHROOM2Q13796 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC46.54■■■■■ 5.04
SHROOM2Q13796 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.5■■■■■ 5.04
SHROOM2Q13796 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC46.5■■■■■ 5.03
SHROOM2Q13796 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC46.5■■■■■ 5.03
SHROOM2Q13796 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC46.49■■■■■ 5.03
SHROOM2Q13796 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC46.46■■■■■ 5.03
SHROOM2Q13796 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC46.46■■■■■ 5.03
SHROOM2Q13796 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.4■■■■■ 5.02
SHROOM2Q13796 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC46.39■■■■■ 5.02
SHROOM2Q13796 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.39■■■■■ 5.02
SHROOM2Q13796 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46.37■■■■■ 5.01
SHROOM2Q13796 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
SHROOM2Q13796 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC46.35■■■■■ 5.01
SHROOM2Q13796 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC46.35■■■■■ 5.01
SHROOM2Q13796 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC46.33■■■■■ 5.01
SHROOM2Q13796 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC46.33■■■■■ 5.01
SHROOM2Q13796 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC46.28■■■■■ 5
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