Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
PICALMQ13492 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PICALMQ13492 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PICALMQ13492 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
PICALMQ13492 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
PICALMQ13492 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PICALMQ13492 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
PICALMQ13492 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
PICALMQ13492 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PICALMQ13492 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PICALMQ13492 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PICALMQ13492 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PICALMQ13492 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PICALMQ13492 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PICALMQ13492 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PICALMQ13492 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
PICALMQ13492 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
PICALMQ13492 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PICALMQ13492 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PICALMQ13492 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PICALMQ13492 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PICALMQ13492 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PICALMQ13492 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PICALMQ13492 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PICALMQ13492 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PICALMQ13492 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PICALMQ13492 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PICALMQ13492 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PICALMQ13492 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PICALMQ13492 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PICALMQ13492 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PICALMQ13492 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PICALMQ13492 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
PICALMQ13492 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
PICALMQ13492 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
PICALMQ13492 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
PICALMQ13492 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
PICALMQ13492 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PICALMQ13492 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PICALMQ13492 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PICALMQ13492 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
PICALMQ13492 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PICALMQ13492 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
PICALMQ13492 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
PICALMQ13492 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
PICALMQ13492 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PICALMQ13492 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
PICALMQ13492 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PICALMQ13492 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
PICALMQ13492 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
PICALMQ13492 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
PICALMQ13492 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC34.04■■■■□ 3.04
PICALMQ13492 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
PICALMQ13492 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
PICALMQ13492 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC34.02■■■■□ 3.04
PICALMQ13492 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
PICALMQ13492 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
PICALMQ13492 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
PICALMQ13492 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
PICALMQ13492 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
PICALMQ13492 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
PICALMQ13492 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
PICALMQ13492 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
PICALMQ13492 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
PICALMQ13492 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PICALMQ13492 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
PICALMQ13492 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
PICALMQ13492 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
PICALMQ13492 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
PICALMQ13492 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
PICALMQ13492 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
PICALMQ13492 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
PICALMQ13492 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PICALMQ13492 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
PICALMQ13492 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PICALMQ13492 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
PICALMQ13492 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PICALMQ13492 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PICALMQ13492 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
PICALMQ13492 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PICALMQ13492 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PICALMQ13492 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PICALMQ13492 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PICALMQ13492 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PICALMQ13492 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PICALMQ13492 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PICALMQ13492 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
PICALMQ13492 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PICALMQ13492 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PICALMQ13492 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PICALMQ13492 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PICALMQ13492 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PICALMQ13492 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PICALMQ13492 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PICALMQ13492 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PICALMQ13492 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PICALMQ13492 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PICALMQ13492 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PICALMQ13492 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PICALMQ13492 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
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