Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FOXC1Q12948 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
FOXC1Q12948 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FOXC1Q12948 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXC1Q12948 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FOXC1Q12948 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
FOXC1Q12948 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
FOXC1Q12948 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXC1Q12948 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXC1Q12948 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FOXC1Q12948 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FOXC1Q12948 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FOXC1Q12948 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FOXC1Q12948 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FOXC1Q12948 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FOXC1Q12948 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
FOXC1Q12948 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
FOXC1Q12948 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
FOXC1Q12948 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXC1Q12948 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOXC1Q12948 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXC1Q12948 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXC1Q12948 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FOXC1Q12948 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FOXC1Q12948 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
FOXC1Q12948 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXC1Q12948 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXC1Q12948 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FOXC1Q12948 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXC1Q12948 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXC1Q12948 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXC1Q12948 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FOXC1Q12948 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FOXC1Q12948 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXC1Q12948 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
FOXC1Q12948 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXC1Q12948 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOXC1Q12948 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOXC1Q12948 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FOXC1Q12948 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FOXC1Q12948 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FOXC1Q12948 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
FOXC1Q12948 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FOXC1Q12948 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FOXC1Q12948 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FOXC1Q12948 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FOXC1Q12948 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
FOXC1Q12948 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
FOXC1Q12948 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FOXC1Q12948 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
FOXC1Q12948 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FOXC1Q12948 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FOXC1Q12948 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FOXC1Q12948 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FOXC1Q12948 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FOXC1Q12948 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
FOXC1Q12948 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FOXC1Q12948 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FOXC1Q12948 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FOXC1Q12948 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FOXC1Q12948 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
FOXC1Q12948 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
FOXC1Q12948 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FOXC1Q12948 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXC1Q12948 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
FOXC1Q12948 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXC1Q12948 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FOXC1Q12948 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FOXC1Q12948 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
FOXC1Q12948 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXC1Q12948 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXC1Q12948 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
FOXC1Q12948 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXC1Q12948 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FOXC1Q12948 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
FOXC1Q12948 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FOXC1Q12948 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FOXC1Q12948 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FOXC1Q12948 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
FOXC1Q12948 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
FOXC1Q12948 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FOXC1Q12948 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FOXC1Q12948 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOXC1Q12948 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FOXC1Q12948 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FOXC1Q12948 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOXC1Q12948 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FOXC1Q12948 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FOXC1Q12948 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FOXC1Q12948 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FOXC1Q12948 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.56■■■□□ 2
FOXC1Q12948 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.56■■■□□ 2
FOXC1Q12948 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
FOXC1Q12948 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FOXC1Q12948 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
FOXC1Q12948 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXC1Q12948 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
FOXC1Q12948 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FOXC1Q12948 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FOXC1Q12948 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
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