Protein–RNA interactions for Protein: Q01459

CTBS, Di-N-acetylchitobiase, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBSQ01459 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CTBSQ01459 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CTBSQ01459 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CTBSQ01459 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CTBSQ01459 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CTBSQ01459 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CTBSQ01459 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CTBSQ01459 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CTBSQ01459 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CTBSQ01459 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CTBSQ01459 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CTBSQ01459 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CTBSQ01459 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
CTBSQ01459 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTBSQ01459 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTBSQ01459 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CTBSQ01459 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CTBSQ01459 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CTBSQ01459 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CTBSQ01459 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CTBSQ01459 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CTBSQ01459 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CTBSQ01459 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTBSQ01459 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTBSQ01459 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CTBSQ01459 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CTBSQ01459 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CTBSQ01459 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTBSQ01459 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CTBSQ01459 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTBSQ01459 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CTBSQ01459 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CTBSQ01459 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTBSQ01459 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CTBSQ01459 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTBSQ01459 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CTBSQ01459 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CTBSQ01459 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTBSQ01459 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTBSQ01459 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTBSQ01459 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTBSQ01459 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTBSQ01459 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTBSQ01459 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTBSQ01459 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTBSQ01459 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTBSQ01459 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTBSQ01459 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTBSQ01459 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CTBSQ01459 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTBSQ01459 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CTBSQ01459 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CTBSQ01459 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CTBSQ01459 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CTBSQ01459 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CTBSQ01459 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CTBSQ01459 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CTBSQ01459 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CTBSQ01459 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTBSQ01459 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTBSQ01459 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CTBSQ01459 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CTBSQ01459 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CTBSQ01459 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CTBSQ01459 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTBSQ01459 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTBSQ01459 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CTBSQ01459 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CTBSQ01459 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CTBSQ01459 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CTBSQ01459 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTBSQ01459 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTBSQ01459 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTBSQ01459 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CTBSQ01459 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTBSQ01459 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTBSQ01459 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTBSQ01459 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTBSQ01459 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTBSQ01459 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTBSQ01459 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTBSQ01459 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTBSQ01459 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTBSQ01459 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CTBSQ01459 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTBSQ01459 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTBSQ01459 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTBSQ01459 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTBSQ01459 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTBSQ01459 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CTBSQ01459 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTBSQ01459 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTBSQ01459 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTBSQ01459 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTBSQ01459 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTBSQ01459 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTBSQ01459 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTBSQ01459 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CTBSQ01459 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CTBSQ01459 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms