Protein–RNA interactions for Protein: Q01167

FOXK2, Forkhead box protein K2, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXK2Q01167 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
FOXK2Q01167 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FOXK2Q01167 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
FOXK2Q01167 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
FOXK2Q01167 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
FOXK2Q01167 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FOXK2Q01167 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
FOXK2Q01167 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
FOXK2Q01167 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
FOXK2Q01167 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
FOXK2Q01167 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FOXK2Q01167 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
FOXK2Q01167 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
FOXK2Q01167 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
FOXK2Q01167 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOXK2Q01167 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
FOXK2Q01167 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FOXK2Q01167 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FOXK2Q01167 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
FOXK2Q01167 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FOXK2Q01167 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOXK2Q01167 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOXK2Q01167 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FOXK2Q01167 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FOXK2Q01167 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FOXK2Q01167 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FOXK2Q01167 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FOXK2Q01167 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FOXK2Q01167 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FOXK2Q01167 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
FOXK2Q01167 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
FOXK2Q01167 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FOXK2Q01167 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FOXK2Q01167 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
FOXK2Q01167 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
FOXK2Q01167 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXK2Q01167 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FOXK2Q01167 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOXK2Q01167 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
FOXK2Q01167 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FOXK2Q01167 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
FOXK2Q01167 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FOXK2Q01167 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FOXK2Q01167 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
FOXK2Q01167 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
FOXK2Q01167 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXK2Q01167 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
FOXK2Q01167 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
FOXK2Q01167 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXK2Q01167 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXK2Q01167 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FOXK2Q01167 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FOXK2Q01167 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FOXK2Q01167 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FOXK2Q01167 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FOXK2Q01167 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FOXK2Q01167 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FOXK2Q01167 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FOXK2Q01167 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FOXK2Q01167 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FOXK2Q01167 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FOXK2Q01167 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXK2Q01167 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FOXK2Q01167 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
FOXK2Q01167 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXK2Q01167 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FOXK2Q01167 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXK2Q01167 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FOXK2Q01167 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FOXK2Q01167 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FOXK2Q01167 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXK2Q01167 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXK2Q01167 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FOXK2Q01167 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FOXK2Q01167 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXK2Q01167 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FOXK2Q01167 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXK2Q01167 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXK2Q01167 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FOXK2Q01167 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
FOXK2Q01167 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXK2Q01167 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXK2Q01167 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FOXK2Q01167 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FOXK2Q01167 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXK2Q01167 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXK2Q01167 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXK2Q01167 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FOXK2Q01167 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
FOXK2Q01167 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FOXK2Q01167 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FOXK2Q01167 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FOXK2Q01167 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FOXK2Q01167 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
FOXK2Q01167 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
FOXK2Q01167 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FOXK2Q01167 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
FOXK2Q01167 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FOXK2Q01167 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FOXK2Q01167 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms