Protein–RNA interactions for Protein: Q01130

SRSF2, Serine/arginine-rich splicing factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF2Q01130 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRSF2Q01130 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SRSF2Q01130 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SRSF2Q01130 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SRSF2Q01130 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRSF2Q01130 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SRSF2Q01130 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SRSF2Q01130 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SRSF2Q01130 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRSF2Q01130 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRSF2Q01130 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRSF2Q01130 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRSF2Q01130 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SRSF2Q01130 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRSF2Q01130 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRSF2Q01130 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SRSF2Q01130 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRSF2Q01130 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SRSF2Q01130 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SRSF2Q01130 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SRSF2Q01130 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SRSF2Q01130 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SRSF2Q01130 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SRSF2Q01130 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SRSF2Q01130 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRSF2Q01130 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SRSF2Q01130 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SRSF2Q01130 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SRSF2Q01130 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRSF2Q01130 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRSF2Q01130 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRSF2Q01130 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SRSF2Q01130 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SRSF2Q01130 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SRSF2Q01130 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRSF2Q01130 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRSF2Q01130 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SRSF2Q01130 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SRSF2Q01130 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SRSF2Q01130 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRSF2Q01130 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRSF2Q01130 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SRSF2Q01130 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SRSF2Q01130 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SRSF2Q01130 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SRSF2Q01130 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRSF2Q01130 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SRSF2Q01130 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SRSF2Q01130 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SRSF2Q01130 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRSF2Q01130 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRSF2Q01130 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SRSF2Q01130 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRSF2Q01130 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRSF2Q01130 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRSF2Q01130 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SRSF2Q01130 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SRSF2Q01130 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRSF2Q01130 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRSF2Q01130 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SRSF2Q01130 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRSF2Q01130 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRSF2Q01130 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SRSF2Q01130 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRSF2Q01130 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SRSF2Q01130 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRSF2Q01130 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRSF2Q01130 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SRSF2Q01130 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SRSF2Q01130 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SRSF2Q01130 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SRSF2Q01130 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRSF2Q01130 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SRSF2Q01130 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SRSF2Q01130 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SRSF2Q01130 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRSF2Q01130 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SRSF2Q01130 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRSF2Q01130 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SRSF2Q01130 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SRSF2Q01130 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SRSF2Q01130 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRSF2Q01130 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SRSF2Q01130 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRSF2Q01130 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SRSF2Q01130 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SRSF2Q01130 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRSF2Q01130 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SRSF2Q01130 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SRSF2Q01130 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SRSF2Q01130 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRSF2Q01130 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRSF2Q01130 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SRSF2Q01130 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRSF2Q01130 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRSF2Q01130 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRSF2Q01130 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SRSF2Q01130 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRSF2Q01130 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SRSF2Q01130 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms