Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SMAD3P84022 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
SMAD3P84022 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
SMAD3P84022 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
SMAD3P84022 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
SMAD3P84022 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
SMAD3P84022 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SMAD3P84022 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
SMAD3P84022 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
SMAD3P84022 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SMAD3P84022 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SMAD3P84022 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SMAD3P84022 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SMAD3P84022 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SMAD3P84022 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SMAD3P84022 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
SMAD3P84022 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SMAD3P84022 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
SMAD3P84022 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SMAD3P84022 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
SMAD3P84022 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
SMAD3P84022 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
SMAD3P84022 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
SMAD3P84022 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
SMAD3P84022 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SMAD3P84022 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
SMAD3P84022 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
SMAD3P84022 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SMAD3P84022 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
SMAD3P84022 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SMAD3P84022 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SMAD3P84022 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SMAD3P84022 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SMAD3P84022 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SMAD3P84022 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SMAD3P84022 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SMAD3P84022 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SMAD3P84022 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SMAD3P84022 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SMAD3P84022 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SMAD3P84022 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SMAD3P84022 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SMAD3P84022 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
SMAD3P84022 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
SMAD3P84022 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SMAD3P84022 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
SMAD3P84022 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.65
SMAD3P84022 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SMAD3P84022 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SMAD3P84022 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SMAD3P84022 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SMAD3P84022 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
SMAD3P84022 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SMAD3P84022 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
SMAD3P84022 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SMAD3P84022 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SMAD3P84022 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
SMAD3P84022 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.63
SMAD3P84022 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SMAD3P84022 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SMAD3P84022 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SMAD3P84022 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SMAD3P84022 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SMAD3P84022 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SMAD3P84022 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SMAD3P84022 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SMAD3P84022 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
SMAD3P84022 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
SMAD3P84022 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SMAD3P84022 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
SMAD3P84022 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SMAD3P84022 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SMAD3P84022 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SMAD3P84022 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SMAD3P84022 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SMAD3P84022 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
SMAD3P84022 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
SMAD3P84022 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SMAD3P84022 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SMAD3P84022 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SMAD3P84022 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SMAD3P84022 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SMAD3P84022 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SMAD3P84022 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SMAD3P84022 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SMAD3P84022 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
SMAD3P84022 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SMAD3P84022 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SMAD3P84022 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SMAD3P84022 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SMAD3P84022 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
SMAD3P84022 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
SMAD3P84022 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SMAD3P84022 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
SMAD3P84022 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SMAD3P84022 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SMAD3P84022 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SMAD3P84022 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
SMAD3P84022 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SMAD3P84022 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms