Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
ERVK-24P63145 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
ERVK-24P63145 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ERVK-24P63145 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
ERVK-24P63145 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
ERVK-24P63145 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
ERVK-24P63145 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ERVK-24P63145 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ERVK-24P63145 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ERVK-24P63145 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
ERVK-24P63145 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ERVK-24P63145 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ERVK-24P63145 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ERVK-24P63145 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ERVK-24P63145 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
ERVK-24P63145 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ERVK-24P63145 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ERVK-24P63145 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ERVK-24P63145 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ERVK-24P63145 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ERVK-24P63145 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ERVK-24P63145 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
ERVK-24P63145 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ERVK-24P63145 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ERVK-24P63145 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ERVK-24P63145 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ERVK-24P63145 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
ERVK-24P63145 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ERVK-24P63145 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ERVK-24P63145 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ERVK-24P63145 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ERVK-24P63145 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
ERVK-24P63145 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ERVK-24P63145 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ERVK-24P63145 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ERVK-24P63145 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ERVK-24P63145 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ERVK-24P63145 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ERVK-24P63145 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ERVK-24P63145 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ERVK-24P63145 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ERVK-24P63145 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ERVK-24P63145 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ERVK-24P63145 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ERVK-24P63145 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ERVK-24P63145 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ERVK-24P63145 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ERVK-24P63145 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
ERVK-24P63145 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
ERVK-24P63145 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
ERVK-24P63145 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ERVK-24P63145 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ERVK-24P63145 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ERVK-24P63145 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ERVK-24P63145 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ERVK-24P63145 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ERVK-24P63145 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ERVK-24P63145 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ERVK-24P63145 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ERVK-24P63145 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ERVK-24P63145 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ERVK-24P63145 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ERVK-24P63145 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
ERVK-24P63145 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
ERVK-24P63145 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
ERVK-24P63145 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
ERVK-24P63145 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ERVK-24P63145 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ERVK-24P63145 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ERVK-24P63145 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ERVK-24P63145 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
ERVK-24P63145 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ERVK-24P63145 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ERVK-24P63145 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ERVK-24P63145 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
ERVK-24P63145 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ERVK-24P63145 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ERVK-24P63145 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ERVK-24P63145 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
ERVK-24P63145 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ERVK-24P63145 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ERVK-24P63145 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ERVK-24P63145 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
ERVK-24P63145 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
ERVK-24P63145 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ERVK-24P63145 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ERVK-24P63145 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ERVK-24P63145 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ERVK-24P63145 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ERVK-24P63145 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ERVK-24P63145 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ERVK-24P63145 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
ERVK-24P63145 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ERVK-24P63145 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ERVK-24P63145 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ERVK-24P63145 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ERVK-24P63145 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ERVK-24P63145 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ERVK-24P63145 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ERVK-24P63145 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms