Protein–RNA interactions for Protein: P61812

TGFB2, Transforming growth factor beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB2P61812 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
TGFB2P61812 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
TGFB2P61812 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
TGFB2P61812 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
TGFB2P61812 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
TGFB2P61812 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
TGFB2P61812 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
TGFB2P61812 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
TGFB2P61812 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
TGFB2P61812 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
TGFB2P61812 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
TGFB2P61812 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
TGFB2P61812 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
TGFB2P61812 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
TGFB2P61812 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.88■■■■□ 3.5
TGFB2P61812 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
TGFB2P61812 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC36.83■■■■□ 3.49
TGFB2P61812 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
TGFB2P61812 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC36.82■■■■□ 3.48
TGFB2P61812 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
TGFB2P61812 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
TGFB2P61812 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
TGFB2P61812 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
TGFB2P61812 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
TGFB2P61812 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
TGFB2P61812 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
TGFB2P61812 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
TGFB2P61812 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
TGFB2P61812 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
TGFB2P61812 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
TGFB2P61812 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
TGFB2P61812 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
TGFB2P61812 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
TGFB2P61812 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
TGFB2P61812 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
TGFB2P61812 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
TGFB2P61812 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
TGFB2P61812 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
TGFB2P61812 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
TGFB2P61812 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC36.48■■■■□ 3.43
TGFB2P61812 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
TGFB2P61812 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
TGFB2P61812 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
TGFB2P61812 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
TGFB2P61812 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
TGFB2P61812 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
TGFB2P61812 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
TGFB2P61812 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
TGFB2P61812 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
TGFB2P61812 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
TGFB2P61812 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
TGFB2P61812 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TGFB2P61812 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
TGFB2P61812 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TGFB2P61812 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC36.26■■■■□ 3.4
TGFB2P61812 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
TGFB2P61812 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TGFB2P61812 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TGFB2P61812 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TGFB2P61812 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
TGFB2P61812 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
TGFB2P61812 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
TGFB2P61812 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
TGFB2P61812 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
TGFB2P61812 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
TGFB2P61812 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
TGFB2P61812 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
TGFB2P61812 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
TGFB2P61812 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
TGFB2P61812 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
TGFB2P61812 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
TGFB2P61812 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
TGFB2P61812 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
TGFB2P61812 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
TGFB2P61812 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
TGFB2P61812 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
TGFB2P61812 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
TGFB2P61812 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
TGFB2P61812 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
TGFB2P61812 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC35.85■■■■□ 3.33
TGFB2P61812 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
TGFB2P61812 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
TGFB2P61812 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
TGFB2P61812 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TGFB2P61812 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
TGFB2P61812 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
TGFB2P61812 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
TGFB2P61812 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
TGFB2P61812 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
TGFB2P61812 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
TGFB2P61812 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
TGFB2P61812 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
TGFB2P61812 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
TGFB2P61812 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
TGFB2P61812 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
TGFB2P61812 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
TGFB2P61812 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
TGFB2P61812 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
TGFB2P61812 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
TGFB2P61812 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms