Protein–RNA interactions for Protein: P56381

ATP5E, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5EP56381 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5EP56381 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ATP5EP56381 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ATP5EP56381 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ATP5EP56381 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ATP5EP56381 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ATP5EP56381 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5EP56381 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ATP5EP56381 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ATP5EP56381 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATP5EP56381 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5EP56381 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATP5EP56381 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP5EP56381 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP5EP56381 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5EP56381 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5EP56381 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5EP56381 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5EP56381 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5EP56381 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5EP56381 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATP5EP56381 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATP5EP56381 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATP5EP56381 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5EP56381 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATP5EP56381 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATP5EP56381 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ATP5EP56381 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP5EP56381 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ATP5EP56381 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP5EP56381 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ATP5EP56381 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP5EP56381 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP5EP56381 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5EP56381 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP5EP56381 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP5EP56381 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
ATP5EP56381 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5EP56381 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ATP5EP56381 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP5EP56381 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP5EP56381 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP5EP56381 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ATP5EP56381 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP5EP56381 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP5EP56381 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP5EP56381 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP5EP56381 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5EP56381 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5EP56381 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP5EP56381 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5EP56381 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5EP56381 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5EP56381 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP5EP56381 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5EP56381 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ATP5EP56381 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5EP56381 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ATP5EP56381 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ATP5EP56381 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ATP5EP56381 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ATP5EP56381 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ATP5EP56381 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5EP56381 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ATP5EP56381 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5EP56381 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5EP56381 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ATP5EP56381 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP5EP56381 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP5EP56381 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ATP5EP56381 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP5EP56381 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP5EP56381 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ATP5EP56381 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ATP5EP56381 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5EP56381 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5EP56381 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5EP56381 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5EP56381 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ATP5EP56381 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5EP56381 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ATP5EP56381 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5EP56381 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ATP5EP56381 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ATP5EP56381 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5EP56381 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5EP56381 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ATP5EP56381 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5EP56381 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ATP5EP56381 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5EP56381 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ATP5EP56381 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5EP56381 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ATP5EP56381 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5EP56381 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5EP56381 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ATP5EP56381 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ATP5EP56381 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ATP5EP56381 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATP5EP56381 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms