Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

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Length 987 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
EPHB4P54760 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
EPHB4P54760 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
EPHB4P54760 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
EPHB4P54760 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
EPHB4P54760 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
EPHB4P54760 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
EPHB4P54760 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
EPHB4P54760 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
EPHB4P54760 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
EPHB4P54760 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
EPHB4P54760 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
EPHB4P54760 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
EPHB4P54760 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
EPHB4P54760 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
EPHB4P54760 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
EPHB4P54760 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
EPHB4P54760 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
EPHB4P54760 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
EPHB4P54760 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
EPHB4P54760 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
EPHB4P54760 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
EPHB4P54760 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
EPHB4P54760 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
EPHB4P54760 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
EPHB4P54760 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
EPHB4P54760 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
EPHB4P54760 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
EPHB4P54760 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
EPHB4P54760 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
EPHB4P54760 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
EPHB4P54760 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
EPHB4P54760 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
EPHB4P54760 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
EPHB4P54760 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
EPHB4P54760 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
EPHB4P54760 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
EPHB4P54760 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
EPHB4P54760 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
EPHB4P54760 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
EPHB4P54760 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
EPHB4P54760 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
EPHB4P54760 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
EPHB4P54760 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
EPHB4P54760 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
EPHB4P54760 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
EPHB4P54760 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
EPHB4P54760 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
EPHB4P54760 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
EPHB4P54760 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
EPHB4P54760 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
EPHB4P54760 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
EPHB4P54760 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
EPHB4P54760 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
EPHB4P54760 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
EPHB4P54760 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
EPHB4P54760 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
EPHB4P54760 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
EPHB4P54760 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
EPHB4P54760 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
EPHB4P54760 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
EPHB4P54760 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
EPHB4P54760 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
EPHB4P54760 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
EPHB4P54760 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
EPHB4P54760 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
EPHB4P54760 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
EPHB4P54760 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
EPHB4P54760 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
EPHB4P54760 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
EPHB4P54760 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
EPHB4P54760 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
EPHB4P54760 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
EPHB4P54760 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
EPHB4P54760 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
EPHB4P54760 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
EPHB4P54760 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
EPHB4P54760 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
EPHB4P54760 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
EPHB4P54760 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
EPHB4P54760 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
EPHB4P54760 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
EPHB4P54760 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
EPHB4P54760 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
EPHB4P54760 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
EPHB4P54760 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
EPHB4P54760 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
EPHB4P54760 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
EPHB4P54760 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
EPHB4P54760 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
EPHB4P54760 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
EPHB4P54760 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
EPHB4P54760 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
EPHB4P54760 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
EPHB4P54760 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
EPHB4P54760 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
EPHB4P54760 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
EPHB4P54760 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
EPHB4P54760 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
EPHB4P54760 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
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