Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC42.82■■■■■ 4.45
CPS1P31327 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC42.81■■■■■ 4.44
CPS1P31327 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
CPS1P31327 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC42.75■■■■■ 4.43
CPS1P31327 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC42.7■■■■■ 4.43
CPS1P31327 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC42.64■■■■■ 4.42
CPS1P31327 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC42.59■■■■■ 4.41
CPS1P31327 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
CPS1P31327 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
CPS1P31327 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
CPS1P31327 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
CPS1P31327 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC42.45■■■■■ 4.39
CPS1P31327 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC42.43■■■■■ 4.38
CPS1P31327 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
CPS1P31327 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
CPS1P31327 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
CPS1P31327 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
CPS1P31327 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC42.3■■■■■ 4.36
CPS1P31327 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC42.24■■■■■ 4.35
CPS1P31327 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC42.15■■■■■ 4.34
CPS1P31327 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
CPS1P31327 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
CPS1P31327 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
CPS1P31327 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC42.05■■■■■ 4.32
CPS1P31327 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
CPS1P31327 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
CPS1P31327 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
CPS1P31327 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
CPS1P31327 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
CPS1P31327 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.97■■■■■ 4.31
CPS1P31327 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
CPS1P31327 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC41.95■■■■■ 4.31
CPS1P31327 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC41.92■■■■■ 4.3
CPS1P31327 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC41.91■■■■■ 4.3
CPS1P31327 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC41.91■■■■■ 4.3
CPS1P31327 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC41.9■■■■■ 4.3
CPS1P31327 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC41.89■■■■■ 4.3
CPS1P31327 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
CPS1P31327 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
CPS1P31327 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.81■■■■■ 4.28
CPS1P31327 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
CPS1P31327 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
CPS1P31327 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC41.79■■■■■ 4.28
CPS1P31327 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC41.77■■■■■ 4.28
CPS1P31327 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC41.76■■■■■ 4.28
CPS1P31327 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC41.75■■■■■ 4.27
CPS1P31327 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
CPS1P31327 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC41.69■■■■■ 4.26
CPS1P31327 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
CPS1P31327 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC41.69■■■■■ 4.26
CPS1P31327 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
CPS1P31327 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC41.66■■■■■ 4.26
CPS1P31327 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.61■■■■■ 4.25
CPS1P31327 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC41.61■■■■■ 4.25
CPS1P31327 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.25
CPS1P31327 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.25
CPS1P31327 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.25
CPS1P31327 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.56■■■■■ 4.24
CPS1P31327 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC41.56■■■■■ 4.24
CPS1P31327 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
CPS1P31327 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC41.51■■■■■ 4.24
CPS1P31327 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.5■■■■■ 4.23
CPS1P31327 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
CPS1P31327 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
CPS1P31327 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.42■■■■■ 4.22
CPS1P31327 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC41.4■■■■■ 4.22
CPS1P31327 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC41.39■■■■■ 4.22
CPS1P31327 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
CPS1P31327 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC41.28■■■■■ 4.2
CPS1P31327 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC41.26■■■■■ 4.19
CPS1P31327 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.23■■■■■ 4.19
CPS1P31327 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
CPS1P31327 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
CPS1P31327 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
CPS1P31327 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC41.18■■■■■ 4.18
CPS1P31327 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
CPS1P31327 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
CPS1P31327 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.17■■■■■ 4.18
CPS1P31327 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
CPS1P31327 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
CPS1P31327 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
CPS1P31327 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC41.13■■■■■ 4.18
CPS1P31327 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
CPS1P31327 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.11■■■■■ 4.17
CPS1P31327 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC41.1■■■■■ 4.17
CPS1P31327 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
CPS1P31327 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
CPS1P31327 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC41.08■■■■■ 4.17
CPS1P31327 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
CPS1P31327 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
CPS1P31327 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC41.06■■■■■ 4.16
CPS1P31327 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC41.06■■■■■ 4.16
CPS1P31327 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
CPS1P31327 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
CPS1P31327 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC41.05■■■■■ 4.16
CPS1P31327 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.02■■■■■ 4.16
CPS1P31327 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
CPS1P31327 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
CPS1P31327 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
CPS1P31327 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.6 ms