Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRKCHP24723 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRKCHP24723 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRKCHP24723 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRKCHP24723 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PRKCHP24723 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PRKCHP24723 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PRKCHP24723 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PRKCHP24723 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PRKCHP24723 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRKCHP24723 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PRKCHP24723 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
PRKCHP24723 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRKCHP24723 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PRKCHP24723 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRKCHP24723 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PRKCHP24723 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PRKCHP24723 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PRKCHP24723 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PRKCHP24723 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PRKCHP24723 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PRKCHP24723 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PRKCHP24723 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PRKCHP24723 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRKCHP24723 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRKCHP24723 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PRKCHP24723 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRKCHP24723 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRKCHP24723 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PRKCHP24723 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PRKCHP24723 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PRKCHP24723 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PRKCHP24723 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PRKCHP24723 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRKCHP24723 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PRKCHP24723 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PRKCHP24723 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PRKCHP24723 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PRKCHP24723 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRKCHP24723 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PRKCHP24723 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PRKCHP24723 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRKCHP24723 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRKCHP24723 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRKCHP24723 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRKCHP24723 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRKCHP24723 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PRKCHP24723 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PRKCHP24723 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PRKCHP24723 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRKCHP24723 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PRKCHP24723 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRKCHP24723 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRKCHP24723 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PRKCHP24723 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PRKCHP24723 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRKCHP24723 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRKCHP24723 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PRKCHP24723 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PRKCHP24723 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRKCHP24723 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PRKCHP24723 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PRKCHP24723 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PRKCHP24723 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRKCHP24723 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PRKCHP24723 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRKCHP24723 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PRKCHP24723 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PRKCHP24723 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRKCHP24723 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRKCHP24723 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRKCHP24723 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PRKCHP24723 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRKCHP24723 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRKCHP24723 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PRKCHP24723 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PRKCHP24723 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRKCHP24723 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PRKCHP24723 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PRKCHP24723 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PRKCHP24723 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PRKCHP24723 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRKCHP24723 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PRKCHP24723 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRKCHP24723 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PRKCHP24723 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PRKCHP24723 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PRKCHP24723 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PRKCHP24723 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRKCHP24723 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRKCHP24723 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRKCHP24723 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRKCHP24723 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRKCHP24723 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRKCHP24723 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRKCHP24723 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRKCHP24723 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRKCHP24723 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRKCHP24723 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRKCHP24723 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms