Protein–RNA interactions for Protein: P15248

IL9, Interleukin-9, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL9P15248 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
IL9P15248 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
IL9P15248 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
IL9P15248 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
IL9P15248 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC31.2■■■□□ 2.59
IL9P15248 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
IL9P15248 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
IL9P15248 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
IL9P15248 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
IL9P15248 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
IL9P15248 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
IL9P15248 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
IL9P15248 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
IL9P15248 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
IL9P15248 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
IL9P15248 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
IL9P15248 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.87■■■□□ 2.53
IL9P15248 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
IL9P15248 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
IL9P15248 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
IL9P15248 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
IL9P15248 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
IL9P15248 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
IL9P15248 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
IL9P15248 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
IL9P15248 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
IL9P15248 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
IL9P15248 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
IL9P15248 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
IL9P15248 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
IL9P15248 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
IL9P15248 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
IL9P15248 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
IL9P15248 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
IL9P15248 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
IL9P15248 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
IL9P15248 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
IL9P15248 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
IL9P15248 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
IL9P15248 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
IL9P15248 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
IL9P15248 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
IL9P15248 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
IL9P15248 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
IL9P15248 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
IL9P15248 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
IL9P15248 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
IL9P15248 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
IL9P15248 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
IL9P15248 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
IL9P15248 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
IL9P15248 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
IL9P15248 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
IL9P15248 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
IL9P15248 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
IL9P15248 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.45
IL9P15248 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
IL9P15248 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
IL9P15248 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
IL9P15248 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
IL9P15248 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
IL9P15248 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
IL9P15248 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
IL9P15248 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
IL9P15248 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
IL9P15248 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
IL9P15248 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
IL9P15248 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
IL9P15248 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
IL9P15248 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
IL9P15248 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
IL9P15248 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
IL9P15248 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
IL9P15248 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
IL9P15248 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
IL9P15248 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
IL9P15248 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
IL9P15248 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
IL9P15248 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
IL9P15248 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
IL9P15248 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
IL9P15248 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
IL9P15248 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
IL9P15248 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
IL9P15248 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
IL9P15248 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
IL9P15248 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
IL9P15248 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
IL9P15248 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
IL9P15248 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
IL9P15248 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
IL9P15248 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
IL9P15248 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
IL9P15248 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
IL9P15248 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
IL9P15248 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
IL9P15248 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
IL9P15248 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
IL9P15248 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
IL9P15248 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms