Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HOXB3P14651 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.15
HOXB3P14651 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HOXB3P14651 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HOXB3P14651 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HOXB3P14651 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HOXB3P14651 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HOXB3P14651 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
HOXB3P14651 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HOXB3P14651 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HOXB3P14651 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXB3P14651 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
HOXB3P14651 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HOXB3P14651 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HOXB3P14651 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HOXB3P14651 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HOXB3P14651 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HOXB3P14651 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HOXB3P14651 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXB3P14651 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXB3P14651 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXB3P14651 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXB3P14651 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXB3P14651 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOXB3P14651 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXB3P14651 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXB3P14651 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HOXB3P14651 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HOXB3P14651 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HOXB3P14651 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXB3P14651 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXB3P14651 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXB3P14651 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXB3P14651 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXB3P14651 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXB3P14651 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXB3P14651 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXB3P14651 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HOXB3P14651 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXB3P14651 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HOXB3P14651 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
HOXB3P14651 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HOXB3P14651 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
HOXB3P14651 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXB3P14651 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXB3P14651 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HOXB3P14651 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXB3P14651 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXB3P14651 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXB3P14651 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXB3P14651 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
HOXB3P14651 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXB3P14651 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXB3P14651 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HOXB3P14651 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXB3P14651 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXB3P14651 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXB3P14651 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXB3P14651 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXB3P14651 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXB3P14651 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXB3P14651 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXB3P14651 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXB3P14651 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXB3P14651 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXB3P14651 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXB3P14651 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXB3P14651 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXB3P14651 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXB3P14651 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXB3P14651 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXB3P14651 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXB3P14651 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXB3P14651 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXB3P14651 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXB3P14651 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXB3P14651 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXB3P14651 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXB3P14651 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HOXB3P14651 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HOXB3P14651 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HOXB3P14651 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HOXB3P14651 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXB3P14651 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXB3P14651 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXB3P14651 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOXB3P14651 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HOXB3P14651 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HOXB3P14651 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
HOXB3P14651 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HOXB3P14651 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HOXB3P14651 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXB3P14651 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HOXB3P14651 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HOXB3P14651 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXB3P14651 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HOXB3P14651 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXB3P14651 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXB3P14651 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HOXB3P14651 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms