Protein–RNA interactions for Protein: P11802

CDK4, Cyclin-dependent kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK4P11802 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK4P11802 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK4P11802 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK4P11802 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CDK4P11802 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CDK4P11802 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK4P11802 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK4P11802 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK4P11802 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK4P11802 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CDK4P11802 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK4P11802 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CDK4P11802 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CDK4P11802 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK4P11802 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CDK4P11802 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK4P11802 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK4P11802 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK4P11802 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK4P11802 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDK4P11802 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDK4P11802 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDK4P11802 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDK4P11802 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDK4P11802 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDK4P11802 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK4P11802 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK4P11802 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK4P11802 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK4P11802 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDK4P11802 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDK4P11802 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDK4P11802 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDK4P11802 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK4P11802 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK4P11802 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDK4P11802 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK4P11802 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDK4P11802 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDK4P11802 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDK4P11802 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK4P11802 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDK4P11802 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDK4P11802 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDK4P11802 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDK4P11802 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDK4P11802 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDK4P11802 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDK4P11802 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDK4P11802 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CDK4P11802 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK4P11802 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK4P11802 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK4P11802 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDK4P11802 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDK4P11802 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDK4P11802 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CDK4P11802 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDK4P11802 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CDK4P11802 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK4P11802 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK4P11802 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK4P11802 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK4P11802 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK4P11802 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK4P11802 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDK4P11802 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CDK4P11802 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDK4P11802 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDK4P11802 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK4P11802 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK4P11802 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK4P11802 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK4P11802 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK4P11802 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK4P11802 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK4P11802 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK4P11802 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK4P11802 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CDK4P11802 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CDK4P11802 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK4P11802 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK4P11802 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CDK4P11802 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CDK4P11802 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CDK4P11802 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CDK4P11802 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK4P11802 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CDK4P11802 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CDK4P11802 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK4P11802 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK4P11802 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK4P11802 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK4P11802 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CDK4P11802 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CDK4P11802 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDK4P11802 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDK4P11802 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CDK4P11802 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CDK4P11802 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms