Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
RHOP08100 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RHOP08100 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RHOP08100 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RHOP08100 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RHOP08100 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RHOP08100 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
RHOP08100 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
RHOP08100 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
RHOP08100 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
RHOP08100 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
RHOP08100 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
RHOP08100 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
RHOP08100 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
RHOP08100 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
RHOP08100 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RHOP08100 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RHOP08100 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
RHOP08100 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RHOP08100 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RHOP08100 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
RHOP08100 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
RHOP08100 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
RHOP08100 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
RHOP08100 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
RHOP08100 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
RHOP08100 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RHOP08100 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
RHOP08100 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RHOP08100 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
RHOP08100 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RHOP08100 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RHOP08100 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
RHOP08100 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
RHOP08100 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.16■■■□□ 2.42
RHOP08100 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
RHOP08100 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
RHOP08100 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
RHOP08100 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
RHOP08100 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RHOP08100 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RHOP08100 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RHOP08100 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RHOP08100 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
RHOP08100 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RHOP08100 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
RHOP08100 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
RHOP08100 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RHOP08100 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
RHOP08100 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RHOP08100 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RHOP08100 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RHOP08100 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RHOP08100 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
RHOP08100 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
RHOP08100 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RHOP08100 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
RHOP08100 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
RHOP08100 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
RHOP08100 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
RHOP08100 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
RHOP08100 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
RHOP08100 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
RHOP08100 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
RHOP08100 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
RHOP08100 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
RHOP08100 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
RHOP08100 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
RHOP08100 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RHOP08100 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RHOP08100 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
RHOP08100 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RHOP08100 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RHOP08100 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
RHOP08100 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
RHOP08100 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RHOP08100 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
RHOP08100 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RHOP08100 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RHOP08100 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
RHOP08100 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RHOP08100 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
RHOP08100 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RHOP08100 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
RHOP08100 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
RHOP08100 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RHOP08100 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
RHOP08100 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
RHOP08100 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RHOP08100 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
RHOP08100 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RHOP08100 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
RHOP08100 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RHOP08100 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RHOP08100 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RHOP08100 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RHOP08100 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RHOP08100 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RHOP08100 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
RHOP08100 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms