Protein–RNA interactions for Protein: P05109

S100A8, Protein S100-A8, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S100A8P05109 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
S100A8P05109 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
S100A8P05109 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
S100A8P05109 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
S100A8P05109 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
S100A8P05109 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
S100A8P05109 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
S100A8P05109 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
S100A8P05109 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
S100A8P05109 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
S100A8P05109 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
S100A8P05109 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
S100A8P05109 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
S100A8P05109 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
S100A8P05109 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
S100A8P05109 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
S100A8P05109 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
S100A8P05109 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
S100A8P05109 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
S100A8P05109 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
S100A8P05109 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
S100A8P05109 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
S100A8P05109 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
S100A8P05109 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
S100A8P05109 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
S100A8P05109 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
S100A8P05109 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
S100A8P05109 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
S100A8P05109 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
S100A8P05109 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
S100A8P05109 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
S100A8P05109 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
S100A8P05109 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
S100A8P05109 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
S100A8P05109 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
S100A8P05109 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
S100A8P05109 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
S100A8P05109 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
S100A8P05109 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
S100A8P05109 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
S100A8P05109 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
S100A8P05109 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
S100A8P05109 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
S100A8P05109 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
S100A8P05109 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
S100A8P05109 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
S100A8P05109 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
S100A8P05109 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
S100A8P05109 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
S100A8P05109 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
S100A8P05109 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
S100A8P05109 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
S100A8P05109 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
S100A8P05109 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
S100A8P05109 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
S100A8P05109 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
S100A8P05109 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
S100A8P05109 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
S100A8P05109 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
S100A8P05109 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
S100A8P05109 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
S100A8P05109 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
S100A8P05109 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
S100A8P05109 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
S100A8P05109 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
S100A8P05109 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
S100A8P05109 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
S100A8P05109 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
S100A8P05109 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
S100A8P05109 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
S100A8P05109 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
S100A8P05109 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
S100A8P05109 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
S100A8P05109 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
S100A8P05109 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
S100A8P05109 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
S100A8P05109 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
S100A8P05109 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
S100A8P05109 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
S100A8P05109 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
S100A8P05109 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
S100A8P05109 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
S100A8P05109 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
S100A8P05109 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
S100A8P05109 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
S100A8P05109 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
S100A8P05109 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
S100A8P05109 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
S100A8P05109 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
S100A8P05109 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
S100A8P05109 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
S100A8P05109 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
S100A8P05109 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
S100A8P05109 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
S100A8P05109 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
S100A8P05109 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
S100A8P05109 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
S100A8P05109 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
S100A8P05109 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
S100A8P05109 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1999.9 ms