Protein–RNA interactions for Protein: P04217

A1BG, Alpha-1B-glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A1BGP04217 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
A1BGP04217 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
A1BGP04217 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
A1BGP04217 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
A1BGP04217 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC37.39■■■■□ 3.58
A1BGP04217 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
A1BGP04217 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
A1BGP04217 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
A1BGP04217 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
A1BGP04217 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
A1BGP04217 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
A1BGP04217 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
A1BGP04217 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
A1BGP04217 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
A1BGP04217 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
A1BGP04217 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC37.24■■■■□ 3.55
A1BGP04217 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
A1BGP04217 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
A1BGP04217 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
A1BGP04217 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
A1BGP04217 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
A1BGP04217 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
A1BGP04217 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
A1BGP04217 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
A1BGP04217 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
A1BGP04217 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
A1BGP04217 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
A1BGP04217 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
A1BGP04217 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
A1BGP04217 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
A1BGP04217 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
A1BGP04217 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC36.95■■■■□ 3.51
A1BGP04217 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
A1BGP04217 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
A1BGP04217 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
A1BGP04217 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
A1BGP04217 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
A1BGP04217 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
A1BGP04217 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
A1BGP04217 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC36.82■■■■□ 3.48
A1BGP04217 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
A1BGP04217 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
A1BGP04217 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.48
A1BGP04217 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
A1BGP04217 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
A1BGP04217 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC36.73■■■■□ 3.47
A1BGP04217 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
A1BGP04217 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
A1BGP04217 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
A1BGP04217 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
A1BGP04217 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
A1BGP04217 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
A1BGP04217 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
A1BGP04217 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
A1BGP04217 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
A1BGP04217 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
A1BGP04217 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
A1BGP04217 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
A1BGP04217 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
A1BGP04217 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
A1BGP04217 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
A1BGP04217 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
A1BGP04217 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
A1BGP04217 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
A1BGP04217 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
A1BGP04217 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
A1BGP04217 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
A1BGP04217 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
A1BGP04217 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
A1BGP04217 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
A1BGP04217 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
A1BGP04217 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
A1BGP04217 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
A1BGP04217 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
A1BGP04217 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
A1BGP04217 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
A1BGP04217 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
A1BGP04217 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
A1BGP04217 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
A1BGP04217 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
A1BGP04217 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
A1BGP04217 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
A1BGP04217 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
A1BGP04217 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
A1BGP04217 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
A1BGP04217 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
A1BGP04217 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
A1BGP04217 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
A1BGP04217 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
A1BGP04217 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
A1BGP04217 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
A1BGP04217 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
A1BGP04217 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
A1BGP04217 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
A1BGP04217 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
A1BGP04217 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
A1BGP04217 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
A1BGP04217 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
A1BGP04217 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
A1BGP04217 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms