Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
POLR1AO95602 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
POLR1AO95602 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC43.34■■■■■ 4.53
POLR1AO95602 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.53
POLR1AO95602 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
POLR1AO95602 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
POLR1AO95602 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC43.23■■■■■ 4.51
POLR1AO95602 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
POLR1AO95602 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
POLR1AO95602 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.5
POLR1AO95602 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC43.16■■■■■ 4.5
POLR1AO95602 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC43.13■■■■■ 4.49
POLR1AO95602 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
POLR1AO95602 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
POLR1AO95602 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC43.1■■■■■ 4.49
POLR1AO95602 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
POLR1AO95602 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.04■■■■■ 4.48
POLR1AO95602 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
POLR1AO95602 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC42.91■■■■■ 4.46
POLR1AO95602 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
POLR1AO95602 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC42.79■■■■■ 4.44
POLR1AO95602 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC42.74■■■■■ 4.43
POLR1AO95602 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.71■■■■■ 4.43
POLR1AO95602 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC42.69■■■■■ 4.42
POLR1AO95602 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC42.69■■■■■ 4.42
POLR1AO95602 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC42.68■■■■■ 4.42
POLR1AO95602 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
POLR1AO95602 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC42.57■■■■■ 4.4
POLR1AO95602 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.55■■■■■ 4.4
POLR1AO95602 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC42.54■■■■■ 4.4
POLR1AO95602 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.52■■■■■ 4.4
POLR1AO95602 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
POLR1AO95602 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
POLR1AO95602 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC42.48■■■■■ 4.39
POLR1AO95602 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
POLR1AO95602 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
POLR1AO95602 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
POLR1AO95602 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
POLR1AO95602 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
POLR1AO95602 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC42.43■■■■■ 4.38
POLR1AO95602 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
POLR1AO95602 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
POLR1AO95602 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC42.34■■■■■ 4.37
POLR1AO95602 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC42.32■■■■■ 4.36
POLR1AO95602 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
POLR1AO95602 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC42.29■■■■■ 4.36
POLR1AO95602 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
POLR1AO95602 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.26■■■■■ 4.36
POLR1AO95602 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.26■■■■■ 4.36
POLR1AO95602 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.22■■■■■ 4.35
POLR1AO95602 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
POLR1AO95602 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC42.2■■■■■ 4.35
POLR1AO95602 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC42.19■■■■■ 4.34
POLR1AO95602 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC42.17■■■■■ 4.34
POLR1AO95602 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
POLR1AO95602 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC42.13■■■■■ 4.33
POLR1AO95602 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
POLR1AO95602 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC42.09■■■■■ 4.33
POLR1AO95602 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC42.09■■■■■ 4.33
POLR1AO95602 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
POLR1AO95602 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC42.02■■■■■ 4.32
POLR1AO95602 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
POLR1AO95602 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC41.99■■■■■ 4.31
POLR1AO95602 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC41.95■■■■■ 4.31
POLR1AO95602 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC41.88■■■■■ 4.29
POLR1AO95602 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
POLR1AO95602 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
POLR1AO95602 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
POLR1AO95602 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC41.84■■■■■ 4.29
POLR1AO95602 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC41.84■■■■■ 4.29
POLR1AO95602 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
POLR1AO95602 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
POLR1AO95602 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.77■■■■■ 4.28
POLR1AO95602 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
POLR1AO95602 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
POLR1AO95602 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
POLR1AO95602 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC41.68■■■■■ 4.26
POLR1AO95602 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
POLR1AO95602 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
POLR1AO95602 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
POLR1AO95602 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC41.64■■■■■ 4.26
POLR1AO95602 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
POLR1AO95602 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
POLR1AO95602 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
POLR1AO95602 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC41.6■■■■■ 4.25
POLR1AO95602 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
POLR1AO95602 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
POLR1AO95602 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.55■■■■■ 4.24
POLR1AO95602 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
POLR1AO95602 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
POLR1AO95602 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC41.5■■■■■ 4.23
POLR1AO95602 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC41.49■■■■■ 4.23
POLR1AO95602 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
POLR1AO95602 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.48■■■■■ 4.23
POLR1AO95602 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC41.45■■■■■ 4.23
POLR1AO95602 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC41.45■■■■■ 4.23
POLR1AO95602 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
POLR1AO95602 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
POLR1AO95602 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
POLR1AO95602 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.37■■■■■ 4.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms