Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
SLIT2O94813 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
SLIT2O94813 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC40.32■■■■■ 4.05
SLIT2O94813 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.04
SLIT2O94813 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
SLIT2O94813 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC40.26■■■■■ 4.03
SLIT2O94813 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
SLIT2O94813 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
SLIT2O94813 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
SLIT2O94813 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC40.13■■■■■ 4.01
SLIT2O94813 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC40.01■■■■■ 4
SLIT2O94813 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC39.96■■■■□ 3.99
SLIT2O94813 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
SLIT2O94813 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
SLIT2O94813 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC39.89■■■■□ 3.98
SLIT2O94813 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC39.86■■■■□ 3.97
SLIT2O94813 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
SLIT2O94813 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
SLIT2O94813 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC39.81■■■■□ 3.96
SLIT2O94813 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
SLIT2O94813 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
SLIT2O94813 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
SLIT2O94813 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC39.7■■■■□ 3.95
SLIT2O94813 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
SLIT2O94813 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.63■■■■□ 3.93
SLIT2O94813 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
SLIT2O94813 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
SLIT2O94813 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.6■■■■□ 3.93
SLIT2O94813 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
SLIT2O94813 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
SLIT2O94813 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
SLIT2O94813 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC39.51■■■■□ 3.92
SLIT2O94813 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC39.51■■■■□ 3.92
SLIT2O94813 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC39.5■■■■□ 3.91
SLIT2O94813 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
SLIT2O94813 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
SLIT2O94813 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC39.46■■■■□ 3.91
SLIT2O94813 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
SLIT2O94813 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
SLIT2O94813 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC39.41■■■■□ 3.9
SLIT2O94813 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC39.41■■■■□ 3.9
SLIT2O94813 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
SLIT2O94813 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC39.33■■■■□ 3.89
SLIT2O94813 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC39.31■■■■□ 3.88
SLIT2O94813 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC39.3■■■■□ 3.88
SLIT2O94813 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
SLIT2O94813 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC39.29■■■■□ 3.88
SLIT2O94813 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
SLIT2O94813 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
SLIT2O94813 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC39.22■■■■□ 3.87
SLIT2O94813 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC39.21■■■■□ 3.87
SLIT2O94813 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC39.19■■■■□ 3.86
SLIT2O94813 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC39.18■■■■□ 3.86
SLIT2O94813 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
SLIT2O94813 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
SLIT2O94813 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
SLIT2O94813 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
SLIT2O94813 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC39.12■■■■□ 3.85
SLIT2O94813 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
SLIT2O94813 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
SLIT2O94813 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
SLIT2O94813 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.01■■■■□ 3.84
SLIT2O94813 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC39.01■■■■□ 3.84
SLIT2O94813 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
SLIT2O94813 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
SLIT2O94813 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
SLIT2O94813 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
SLIT2O94813 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
SLIT2O94813 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
SLIT2O94813 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
SLIT2O94813 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
SLIT2O94813 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
SLIT2O94813 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
SLIT2O94813 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
SLIT2O94813 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
SLIT2O94813 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
SLIT2O94813 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
SLIT2O94813 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
SLIT2O94813 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
SLIT2O94813 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
SLIT2O94813 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
SLIT2O94813 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
SLIT2O94813 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC38.73■■■■□ 3.79
SLIT2O94813 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
SLIT2O94813 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
SLIT2O94813 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC38.7■■■■□ 3.79
SLIT2O94813 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC38.67■■■■□ 3.78
SLIT2O94813 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
SLIT2O94813 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
SLIT2O94813 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
SLIT2O94813 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
SLIT2O94813 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC38.6■■■■□ 3.77
SLIT2O94813 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
SLIT2O94813 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
SLIT2O94813 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
SLIT2O94813 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
SLIT2O94813 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
SLIT2O94813 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.47■■■■□ 3.75
SLIT2O94813 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
SLIT2O94813 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms