Protein–RNA interactions for Protein: O60832

DKC1, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKC1O60832 SH3BP2-209ENST00000504450 844 ntTSL 511.81□□□□□ -0.527e-34■■■■■ 150.2
DKC1O60832 NCL-202ENST00000356936 890 ntTSL 319.32■□□□□ 0.681e-323■■■■■ 147.3
DKC1O60832 PPP1R8-203ENST00000373931 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.011e-323■■■■■ 146.4
DKC1O60832 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.021e-323■■■■■ 146.4
DKC1O60832 PPP1R8-201ENST00000236412 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.051e-323■■■■■ 146.4
DKC1O60832 PPP1R8-204ENST00000431586 1029 ntTSL 313.9□□□□□ -0.181e-323■■■■■ 146.4
DKC1O60832 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC3.84□□□□□ -1.791e-323■■■■■ 146.4
DKC1O60832 STXBP2-207ENST00000595181 632 ntTSL 211.66□□□□□ -0.542e-30■■■■■ 146.3
DKC1O60832 MATR3-235ENST00000506147 580 ntTSL 417.79■□□□□ 0.441e-323■■■■■ 141.5
DKC1O60832 MATR3-239ENST00000514694 587 ntTSL 417.23■□□□□ 0.351e-323■■■■■ 141.5
DKC1O60832 MATR3-238ENST00000512107 579 ntTSL 416.2■□□□□ 0.181e-323■■■■■ 141.5
DKC1O60832 SNHG4-203ENST00000506188 801 ntTSL 415.83■□□□□ 0.121e-323■■■■■ 141.5
DKC1O60832 SNHG4-201ENST00000448190 542 ntTSL 414.96□□□□□ -0.011e-323■■■■■ 141.5
DKC1O60832 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.11e-323■■■■■ 141.5
DKC1O60832 MATR3-236ENST00000509644 750 ntTSL 314.4□□□□□ -0.11e-323■■■■■ 141.5
DKC1O60832 MATR3-233ENST00000504203 2243 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.161e-323■■■■■ 141.5
DKC1O60832 SNHG4-206ENST00000508735 310 ntTSL 1 (best)13.66□□□□□ -0.221e-323■■■■■ 141.5
DKC1O60832 SNHG4-202ENST00000505522 629 ntTSL 1 (best)13.66□□□□□ -0.221e-323■■■■■ 141.5
DKC1O60832 SNHG4-208ENST00000514110 679 ntTSL 1 (best)13.66□□□□□ -0.221e-323■■■■■ 141.5
DKC1O60832 MATR3-234ENST00000505016 664 ntTSL 213.66□□□□□ -0.221e-323■■■■■ 141.5
DKC1O60832 MATR3-231ENST00000502394 589 ntTSL 413.54□□□□□ -0.241e-323■■■■■ 141.5
DKC1O60832 MATR3-237ENST00000509990 3249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.331e-323■■■■■ 141.5
DKC1O60832 SNHG4-207ENST00000513259 444 ntTSL 59.86□□□□□ -0.831e-323■■■■■ 141.5
DKC1O60832 MATR3-229ENST00000361059 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.971e-323■■■■■ 141.5
DKC1O60832 MATR3-232ENST00000502929 4373 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.991e-323■■■■■ 141.5
DKC1O60832 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.451e-323■■■■■ 141.5
DKC1O60832 SNHG4-205ENST00000507692 575 ntTSL 55.66□□□□□ -1.51e-323■■■■■ 141.5
DKC1O60832 SNORA3.1-201ENST00000408166 111 ntBASIC8.29□□□□□ -1.085e-25■■■■■ 140.2
DKC1O60832 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.23□□□□□ -2.051e-323■■■■■ 139.7
DKC1O60832 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.021e-323■■■■■ 139.4
DKC1O60832 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.121e-323■■■■■ 139.4
DKC1O60832 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.171e-323■■■■■ 139.4
DKC1O60832 NSD2-210ENST00000482415 3602 ntTSL 1 (best)12.9□□□□□ -0.341e-323■■■■■ 139.4
DKC1O60832 NSD2-205ENST00000382892 7706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.381e-323■■■■■ 139.4
DKC1O60832 NSD2-202ENST00000353275 7980 ntTSL 1 (best)11.79□□□□□ -0.521e-323■■■■■ 139.4
DKC1O60832 NSD2-201ENST00000312087 8050 ntTSL 1 (best)11.01□□□□□ -0.651e-323■■■■■ 139.4
DKC1O60832 NSD2-219ENST00000508803 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.91e-323■■■■■ 139.4
DKC1O60832 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC5.37□□□□□ -1.551e-323■■■■■ 139.4
DKC1O60832 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.462e-112■■■■■ 139.3
DKC1O60832 SRGAP2-213ENST00000605242 566 ntTSL 413.38□□□□□ -0.272e-112■■■■■ 139.3
DKC1O60832 SRGAP2-217ENST00000624873 4705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.552e-112■■■■■ 139.3
DKC1O60832 SRGAP2-215ENST00000605610 3212 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.652e-112■■■■■ 139.3
DKC1O60832 SRGAP2-203ENST00000573034 6301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.842e-112■■■■■ 139.3
DKC1O60832 SRGAP2-202ENST00000572793 498 ntTSL 58.5□□□□□ -1.052e-112■■■■■ 139.3
DKC1O60832 SRGAP2-208ENST00000604133 542 ntTSL 55.06□□□□□ -1.62e-112■■■■■ 139.3
DKC1O60832 C14orf159-219ENST00000521077 2719 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.335e-7■■■■■ 138.7
DKC1O60832 C14orf159-201ENST00000256324 2967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.495e-7■■■■■ 138.7
DKC1O60832 C14orf159-204ENST00000428926 2538 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.515e-7■■■■■ 138.7
DKC1O60832 C14orf159-230ENST00000523837 2814 ntTSL 511.83□□□□□ -0.525e-7■■■■■ 138.7
DKC1O60832 C14orf159-223ENST00000522322 2856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.575e-7■■■■■ 138.7
DKC1O60832 C14orf159-229ENST00000523816 2764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.615e-7■■■■■ 138.7
DKC1O60832 C14orf159-217ENST00000520328 2687 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.665e-7■■■■■ 138.7
DKC1O60832 C14orf159-228ENST00000523771 2976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.695e-7■■■■■ 138.7
DKC1O60832 C14orf159-211ENST00000518868 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.745e-7■■■■■ 138.7
DKC1O60832 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.33□□□□□ -2.26e-31■■■■■ 137.3
DKC1O60832 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.74■□□□□ 0.751e-323■■■■■ 137.3
DKC1O60832 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19.37■□□□□ 0.691e-323■■■■■ 137.3
DKC1O60832 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.144e-7■■■■■ 136.7
DKC1O60832 PSD3-207ENST00000518315 1806 ntTSL 214.17□□□□□ -0.146e-22■■■■■ 136.4
DKC1O60832 PSD3-217ENST00000521878 733 ntTSL 510.69□□□□□ -0.76e-22■■■■■ 136.4
DKC1O60832 PSD3-203ENST00000428502 6330 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.86e-22■■■■■ 136.4
DKC1O60832 PSD3-220ENST00000615573 5843 ntTSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.046e-22■■■■■ 136.4
DKC1O60832 PSD3-218ENST00000523619 8145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.156e-22■■■■■ 136.4
DKC1O60832 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.26e-22■■■■■ 136.4
DKC1O60832 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.296e-22■■■■■ 136.4
DKC1O60832 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.41□□□□□ -1.386e-22■■■■■ 136.4
DKC1O60832 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.446e-22■■■■■ 136.4
DKC1O60832 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC6.16□□□□□ -1.421e-30■■■■■ 136.3
DKC1O60832 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.523e-7■■■■■ 134.7
DKC1O60832 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.213e-7■■■■■ 134.7
DKC1O60832 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.133e-7■■■■■ 134.7
DKC1O60832 NCL-207ENST00000461347 3967 ntTSL 215.44■□□□□ 0.061e-323■■■■■ 133.4
DKC1O60832 NCL-201ENST00000322723 4034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.341e-323■■■■■ 133.4
DKC1O60832 TNS1-205ENST00000419504 5921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.051e-7■■■■■ 132.5
DKC1O60832 TNS1-207ENST00000430930 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.051e-7■■■■■ 132.5
DKC1O60832 TNS1-220ENST00000611415 6509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.291e-7■■■■■ 132.5
DKC1O60832 TNS1-221ENST00000615025 6488 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.441e-7■■■■■ 132.5
DKC1O60832 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.154e-81■■■■■ 131.4
DKC1O60832 SNHG21-202ENST00000558174 725 ntTSL 216.01■□□□□ 0.154e-81■■■■■ 131.4
DKC1O60832 SNHG21-205ENST00000561107 790 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.144e-81■■■■■ 131.4
DKC1O60832 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC5.92□□□□□ -1.464e-81■■■■■ 131.4
DKC1O60832 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC0.05□□□□□ -2.44e-81■■■■■ 131.4
DKC1O60832 RNASET2-212ENST00000510083 2280 ntTSL 216.93■□□□□ 0.36e-12■■■■■ 130.4
DKC1O60832 HNF4A-207ENST00000609262 540 ntTSL 1 (best)19.78■□□□□ 0.768e-8■■■■■ 129.3
DKC1O60832 RPSA-203ENST00000444512 701 ntTSL 221.39■■□□□ 1.011e-323■■■■■ 129.1
DKC1O60832 RPSA-206ENST00000477325 596 ntTSL 210.32□□□□□ -0.761e-323■■■■■ 129.1
DKC1O60832 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.46□□□□□ -2.021e-323■■■■■ 129.1
DKC1O60832 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.424e-8■■■■■ 127.7
DKC1O60832 HNF4A-203ENST00000372920 3340 ntTSL 1 (best)18.91■□□□□ 0.624e-8■■■■■ 127.7
DKC1O60832 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.154e-8■■■■■ 127.7
DKC1O60832 HNF4A-201ENST00000316099 6445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.544e-8■■■■■ 127.7
DKC1O60832 TNS1-201ENST00000171887 10331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.791e-7■■■■■ 126.2
DKC1O60832 CCT6A-208ENST00000493855 261 ntTSL 23.07□□□□□ -1.922e-65■■■■■ 123.8
DKC1O60832 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC0.48□□□□□ -2.332e-65■■■■■ 123.8
DKC1O60832 RPL37-202ENST00000504562 505 ntTSL 212.7□□□□□ -0.387e-104■■■■■ 122.9
DKC1O60832 RPL37-205ENST00000509877 637 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.997e-104■■■■■ 122.9
DKC1O60832 RPL37-203ENST00000507642 425 ntTSL 38.32□□□□□ -1.087e-104■■■■■ 122.9
DKC1O60832 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.27e-104■■■■■ 122.9
DKC1O60832 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC0.76□□□□□ -2.297e-104■■■■■ 122.9
DKC1O60832 RERE-203ENST00000400907 2973 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.073e-7■■■■■ 122.3
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