Protein–RNA interactions for Protein: O60603

TLR2, Toll-like receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR2O60603 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TLR2O60603 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TLR2O60603 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TLR2O60603 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TLR2O60603 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
TLR2O60603 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TLR2O60603 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TLR2O60603 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TLR2O60603 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
TLR2O60603 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
TLR2O60603 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
TLR2O60603 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
TLR2O60603 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
TLR2O60603 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
TLR2O60603 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TLR2O60603 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
TLR2O60603 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TLR2O60603 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
TLR2O60603 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
TLR2O60603 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TLR2O60603 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
TLR2O60603 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
TLR2O60603 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
TLR2O60603 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
TLR2O60603 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
TLR2O60603 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
TLR2O60603 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TLR2O60603 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
TLR2O60603 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
TLR2O60603 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
TLR2O60603 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC33.79■■■■□ 3
TLR2O60603 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TLR2O60603 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
TLR2O60603 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TLR2O60603 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
TLR2O60603 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
TLR2O60603 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
TLR2O60603 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
TLR2O60603 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
TLR2O60603 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
TLR2O60603 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
TLR2O60603 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
TLR2O60603 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
TLR2O60603 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TLR2O60603 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
TLR2O60603 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
TLR2O60603 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TLR2O60603 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
TLR2O60603 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TLR2O60603 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TLR2O60603 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
TLR2O60603 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
TLR2O60603 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
TLR2O60603 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
TLR2O60603 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
TLR2O60603 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
TLR2O60603 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TLR2O60603 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
TLR2O60603 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
TLR2O60603 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
TLR2O60603 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TLR2O60603 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
TLR2O60603 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TLR2O60603 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
TLR2O60603 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TLR2O60603 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TLR2O60603 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TLR2O60603 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TLR2O60603 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
TLR2O60603 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
TLR2O60603 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TLR2O60603 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TLR2O60603 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
TLR2O60603 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
TLR2O60603 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TLR2O60603 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
TLR2O60603 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
TLR2O60603 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
TLR2O60603 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
TLR2O60603 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TLR2O60603 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
TLR2O60603 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
TLR2O60603 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
TLR2O60603 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
TLR2O60603 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
TLR2O60603 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
TLR2O60603 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
TLR2O60603 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
TLR2O60603 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
TLR2O60603 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
TLR2O60603 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
TLR2O60603 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
TLR2O60603 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
TLR2O60603 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
TLR2O60603 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
TLR2O60603 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
TLR2O60603 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
TLR2O60603 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
TLR2O60603 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.93■■■□□ 2.86
TLR2O60603 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms