Protein–RNA interactions for Protein: O43379

WDR62, WD repeat-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 1,518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR62O43379 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC51.59■■■■■ 5.85
WDR62O43379 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC51.59■■■■■ 5.85
WDR62O43379 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC51.51■■■■■ 5.84
WDR62O43379 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.5■■■■■ 5.83
WDR62O43379 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC51.44■■■■■ 5.83
WDR62O43379 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.41■■■■■ 5.82
WDR62O43379 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.41■■■■■ 5.82
WDR62O43379 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC51.39■■■■■ 5.82
WDR62O43379 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.35■■■■■ 5.81
WDR62O43379 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC51.31■■■■■ 5.8
WDR62O43379 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.29■■■■■ 5.8
WDR62O43379 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.26■■■■■ 5.8
WDR62O43379 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC51.24■■■■■ 5.79
WDR62O43379 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC51.22■■■■■ 5.79
WDR62O43379 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC51.11■■■■■ 5.77
WDR62O43379 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC51.1■■■■■ 5.77
WDR62O43379 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC51.03■■■■■ 5.76
WDR62O43379 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.02■■■■■ 5.76
WDR62O43379 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC50.87■■■■■ 5.73
WDR62O43379 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC50.79■■■■■ 5.72
WDR62O43379 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC50.79■■■■■ 5.72
WDR62O43379 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.77■■■■■ 5.72
WDR62O43379 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.76■■■■■ 5.72
WDR62O43379 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.73■■■■■ 5.71
WDR62O43379 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.72■■■■■ 5.71
WDR62O43379 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.71■■■■■ 5.71
WDR62O43379 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.68■■■■■ 5.7
WDR62O43379 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.64■■■■■ 5.7
WDR62O43379 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC50.62■■■■■ 5.69
WDR62O43379 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC50.62■■■■■ 5.69
WDR62O43379 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.58■■■■■ 5.69
WDR62O43379 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.57■■■■■ 5.69
WDR62O43379 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC50.57■■■■■ 5.69
WDR62O43379 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC50.53■■■■■ 5.68
WDR62O43379 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC50.51■■■■■ 5.68
WDR62O43379 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC50.5■■■■■ 5.67
WDR62O43379 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC50.49■■■■■ 5.67
WDR62O43379 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC50.41■■■■■ 5.66
WDR62O43379 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC50.41■■■■■ 5.66
WDR62O43379 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.4■■■■■ 5.66
WDR62O43379 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC50.4■■■■■ 5.66
WDR62O43379 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.39■■■■■ 5.66
WDR62O43379 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC50.35■■■■■ 5.65
WDR62O43379 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC50.33■■■■■ 5.65
WDR62O43379 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC50.32■■■■■ 5.65
WDR62O43379 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.26■■■■■ 5.64
WDR62O43379 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC50.21■■■■■ 5.63
WDR62O43379 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC50.2■■■■■ 5.63
WDR62O43379 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.19■■■■■ 5.63
WDR62O43379 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC50.19■■■■■ 5.62
WDR62O43379 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.18■■■■■ 5.62
WDR62O43379 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC50.14■■■■■ 5.62
WDR62O43379 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC50.11■■■■■ 5.61
WDR62O43379 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC50.06■■■■■ 5.6
WDR62O43379 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC50.05■■■■■ 5.6
WDR62O43379 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.03■■■■■ 5.6
WDR62O43379 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.01■■■■■ 5.6
WDR62O43379 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC50.01■■■■■ 5.6
WDR62O43379 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC49.96■■■■■ 5.59
WDR62O43379 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.92■■■■■ 5.58
WDR62O43379 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.91■■■■■ 5.58
WDR62O43379 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.91■■■■■ 5.58
WDR62O43379 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC49.9■■■■■ 5.58
WDR62O43379 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC49.9■■■■■ 5.58
WDR62O43379 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC49.83■■■■■ 5.57
WDR62O43379 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC49.82■■■■■ 5.57
WDR62O43379 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.8■■■■■ 5.56
WDR62O43379 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.79■■■■■ 5.56
WDR62O43379 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC49.78■■■■■ 5.56
WDR62O43379 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.73■■■■■ 5.55
WDR62O43379 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC49.72■■■■■ 5.55
WDR62O43379 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC49.72■■■■■ 5.55
WDR62O43379 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC49.68■■■■■ 5.54
WDR62O43379 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC49.68■■■■■ 5.54
WDR62O43379 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.64■■■■■ 5.54
WDR62O43379 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC49.63■■■■■ 5.54
WDR62O43379 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC49.63■■■■■ 5.54
WDR62O43379 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC49.62■■■■■ 5.53
WDR62O43379 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC49.59■■■■■ 5.53
WDR62O43379 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC49.59■■■■■ 5.53
WDR62O43379 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC49.59■■■■■ 5.53
WDR62O43379 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.58■■■■■ 5.53
WDR62O43379 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.55■■■■■ 5.52
WDR62O43379 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC49.52■■■■■ 5.52
WDR62O43379 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC49.52■■■■■ 5.52
WDR62O43379 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.51■■■■■ 5.52
WDR62O43379 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC49.48■■■■■ 5.51
WDR62O43379 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC49.48■■■■■ 5.51
WDR62O43379 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC49.42■■■■■ 5.5
WDR62O43379 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.41■■■■■ 5.5
WDR62O43379 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.41■■■■■ 5.5
WDR62O43379 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC49.41■■■■■ 5.5
WDR62O43379 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC49.39■■■■■ 5.5
WDR62O43379 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC49.37■■■■■ 5.49
WDR62O43379 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC49.36■■■■■ 5.49
WDR62O43379 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC49.34■■■■■ 5.49
WDR62O43379 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC49.32■■■■■ 5.49
WDR62O43379 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC49.3■■■■■ 5.48
WDR62O43379 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC49.22■■■■■ 5.47
WDR62O43379 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.21■■■■■ 5.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms