Protein–RNA interactions for Protein: O00159

MYO1C, Unconventional myosin-Ic, humanhuman

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1CO00159 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
MYO1CO00159 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
MYO1CO00159 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
MYO1CO00159 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
MYO1CO00159 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
MYO1CO00159 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
MYO1CO00159 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
MYO1CO00159 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MYO1CO00159 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MYO1CO00159 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
MYO1CO00159 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
MYO1CO00159 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MYO1CO00159 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
MYO1CO00159 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MYO1CO00159 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
MYO1CO00159 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MYO1CO00159 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
MYO1CO00159 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
MYO1CO00159 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MYO1CO00159 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MYO1CO00159 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MYO1CO00159 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
MYO1CO00159 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
MYO1CO00159 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MYO1CO00159 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MYO1CO00159 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MYO1CO00159 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MYO1CO00159 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MYO1CO00159 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MYO1CO00159 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MYO1CO00159 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MYO1CO00159 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MYO1CO00159 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MYO1CO00159 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MYO1CO00159 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MYO1CO00159 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MYO1CO00159 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MYO1CO00159 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MYO1CO00159 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MYO1CO00159 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MYO1CO00159 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MYO1CO00159 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MYO1CO00159 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MYO1CO00159 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
MYO1CO00159 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MYO1CO00159 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MYO1CO00159 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MYO1CO00159 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MYO1CO00159 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MYO1CO00159 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MYO1CO00159 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MYO1CO00159 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MYO1CO00159 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
MYO1CO00159 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MYO1CO00159 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MYO1CO00159 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
MYO1CO00159 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MYO1CO00159 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MYO1CO00159 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MYO1CO00159 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MYO1CO00159 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
MYO1CO00159 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
MYO1CO00159 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MYO1CO00159 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MYO1CO00159 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MYO1CO00159 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MYO1CO00159 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MYO1CO00159 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
MYO1CO00159 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
MYO1CO00159 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
MYO1CO00159 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
MYO1CO00159 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
MYO1CO00159 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
MYO1CO00159 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
MYO1CO00159 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MYO1CO00159 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MYO1CO00159 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MYO1CO00159 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MYO1CO00159 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MYO1CO00159 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MYO1CO00159 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MYO1CO00159 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MYO1CO00159 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MYO1CO00159 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MYO1CO00159 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
MYO1CO00159 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MYO1CO00159 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MYO1CO00159 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MYO1CO00159 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
MYO1CO00159 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MYO1CO00159 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MYO1CO00159 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
MYO1CO00159 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MYO1CO00159 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MYO1CO00159 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MYO1CO00159 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYO1CO00159 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MYO1CO00159 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MYO1CO00159 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MYO1CO00159 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms