Protein–RNA interactions for Protein: A0JP26

POTEB3, POTE ankyrin domain family member B3, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEB3A0JP26 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
POTEB3A0JP26 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
POTEB3A0JP26 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
POTEB3A0JP26 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
POTEB3A0JP26 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
POTEB3A0JP26 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
POTEB3A0JP26 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
POTEB3A0JP26 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
POTEB3A0JP26 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
POTEB3A0JP26 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
POTEB3A0JP26 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
POTEB3A0JP26 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
POTEB3A0JP26 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
POTEB3A0JP26 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
POTEB3A0JP26 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
POTEB3A0JP26 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
POTEB3A0JP26 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
POTEB3A0JP26 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
POTEB3A0JP26 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
POTEB3A0JP26 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
POTEB3A0JP26 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
POTEB3A0JP26 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
POTEB3A0JP26 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
POTEB3A0JP26 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
POTEB3A0JP26 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
POTEB3A0JP26 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
POTEB3A0JP26 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
POTEB3A0JP26 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
POTEB3A0JP26 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
POTEB3A0JP26 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
POTEB3A0JP26 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
POTEB3A0JP26 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
POTEB3A0JP26 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
POTEB3A0JP26 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
POTEB3A0JP26 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
POTEB3A0JP26 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
POTEB3A0JP26 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
POTEB3A0JP26 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
POTEB3A0JP26 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
POTEB3A0JP26 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
POTEB3A0JP26 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
POTEB3A0JP26 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
POTEB3A0JP26 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
POTEB3A0JP26 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
POTEB3A0JP26 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
POTEB3A0JP26 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
POTEB3A0JP26 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
POTEB3A0JP26 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
POTEB3A0JP26 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
POTEB3A0JP26 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
POTEB3A0JP26 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
POTEB3A0JP26 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
POTEB3A0JP26 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
POTEB3A0JP26 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
POTEB3A0JP26 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
POTEB3A0JP26 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
POTEB3A0JP26 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
POTEB3A0JP26 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
POTEB3A0JP26 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
POTEB3A0JP26 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC31.89■■■□□ 2.7
POTEB3A0JP26 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
POTEB3A0JP26 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
POTEB3A0JP26 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
POTEB3A0JP26 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
POTEB3A0JP26 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
POTEB3A0JP26 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
POTEB3A0JP26 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
POTEB3A0JP26 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
POTEB3A0JP26 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
POTEB3A0JP26 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
POTEB3A0JP26 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
POTEB3A0JP26 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
POTEB3A0JP26 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
POTEB3A0JP26 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
POTEB3A0JP26 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
POTEB3A0JP26 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
POTEB3A0JP26 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
POTEB3A0JP26 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
POTEB3A0JP26 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
POTEB3A0JP26 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
POTEB3A0JP26 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
POTEB3A0JP26 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
POTEB3A0JP26 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
POTEB3A0JP26 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
POTEB3A0JP26 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
POTEB3A0JP26 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
POTEB3A0JP26 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
POTEB3A0JP26 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
POTEB3A0JP26 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
POTEB3A0JP26 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
POTEB3A0JP26 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
POTEB3A0JP26 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
POTEB3A0JP26 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
POTEB3A0JP26 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
POTEB3A0JP26 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
POTEB3A0JP26 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
POTEB3A0JP26 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
POTEB3A0JP26 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC31.53■■■□□ 2.64
POTEB3A0JP26 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
POTEB3A0JP26 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms