Protein–RNA interactions for Protein: A0A0G2JMD5

PRAMEF33, PRAME family member 33, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF33A0A0G2JMD5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRAMEF33A0A0G2JMD5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRAMEF33A0A0G2JMD5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRAMEF33A0A0G2JMD5 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRAMEF33A0A0G2JMD5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRAMEF33A0A0G2JMD5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRAMEF33A0A0G2JMD5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRAMEF33A0A0G2JMD5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRAMEF33A0A0G2JMD5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRAMEF33A0A0G2JMD5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRAMEF33A0A0G2JMD5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRAMEF33A0A0G2JMD5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRAMEF33A0A0G2JMD5 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PRAMEF33A0A0G2JMD5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PRAMEF33A0A0G2JMD5 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAMEF33A0A0G2JMD5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAMEF33A0A0G2JMD5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PRAMEF33A0A0G2JMD5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PRAMEF33A0A0G2JMD5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PRAMEF33A0A0G2JMD5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PRAMEF33A0A0G2JMD5 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PRAMEF33A0A0G2JMD5 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PRAMEF33A0A0G2JMD5 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRAMEF33A0A0G2JMD5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRAMEF33A0A0G2JMD5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRAMEF33A0A0G2JMD5 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRAMEF33A0A0G2JMD5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRAMEF33A0A0G2JMD5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRAMEF33A0A0G2JMD5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRAMEF33A0A0G2JMD5 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRAMEF33A0A0G2JMD5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRAMEF33A0A0G2JMD5 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRAMEF33A0A0G2JMD5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRAMEF33A0A0G2JMD5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRAMEF33A0A0G2JMD5 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRAMEF33A0A0G2JMD5 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRAMEF33A0A0G2JMD5 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRAMEF33A0A0G2JMD5 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRAMEF33A0A0G2JMD5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRAMEF33A0A0G2JMD5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRAMEF33A0A0G2JMD5 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRAMEF33A0A0G2JMD5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRAMEF33A0A0G2JMD5 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRAMEF33A0A0G2JMD5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRAMEF33A0A0G2JMD5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRAMEF33A0A0G2JMD5 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRAMEF33A0A0G2JMD5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRAMEF33A0A0G2JMD5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRAMEF33A0A0G2JMD5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PRAMEF33A0A0G2JMD5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRAMEF33A0A0G2JMD5 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRAMEF33A0A0G2JMD5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRAMEF33A0A0G2JMD5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PRAMEF33A0A0G2JMD5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PRAMEF33A0A0G2JMD5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PRAMEF33A0A0G2JMD5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRAMEF33A0A0G2JMD5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRAMEF33A0A0G2JMD5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRAMEF33A0A0G2JMD5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRAMEF33A0A0G2JMD5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRAMEF33A0A0G2JMD5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRAMEF33A0A0G2JMD5 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PRAMEF33A0A0G2JMD5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRAMEF33A0A0G2JMD5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRAMEF33A0A0G2JMD5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PRAMEF33A0A0G2JMD5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PRAMEF33A0A0G2JMD5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PRAMEF33A0A0G2JMD5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRAMEF33A0A0G2JMD5 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRAMEF33A0A0G2JMD5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAMEF33A0A0G2JMD5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAMEF33A0A0G2JMD5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRAMEF33A0A0G2JMD5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRAMEF33A0A0G2JMD5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRAMEF33A0A0G2JMD5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRAMEF33A0A0G2JMD5 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRAMEF33A0A0G2JMD5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRAMEF33A0A0G2JMD5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRAMEF33A0A0G2JMD5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAMEF33A0A0G2JMD5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRAMEF33A0A0G2JMD5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PRAMEF33A0A0G2JMD5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PRAMEF33A0A0G2JMD5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRAMEF33A0A0G2JMD5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRAMEF33A0A0G2JMD5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PRAMEF33A0A0G2JMD5 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms