Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYG9

ARPC4-TTLL3, Protein ARPC4-TTLL3, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms