Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PHF11Q9UIL8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PHF11Q9UIL8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms