Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZDHHC3Q9NYG2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ZDHHC3Q9NYG2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZDHHC3Q9NYG2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ZDHHC3Q9NYG2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ZDHHC3Q9NYG2 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ZDHHC3Q9NYG2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms