Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB6

PARD6A, Partitioning defective 6 homolog alpha, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6AQ9NPB6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PARD6AQ9NPB6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PARD6AQ9NPB6 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PARD6AQ9NPB6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PARD6AQ9NPB6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PARD6AQ9NPB6 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PARD6AQ9NPB6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PARD6AQ9NPB6 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PARD6AQ9NPB6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PARD6AQ9NPB6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PARD6AQ9NPB6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PARD6AQ9NPB6 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PARD6AQ9NPB6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PARD6AQ9NPB6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PARD6AQ9NPB6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PARD6AQ9NPB6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PARD6AQ9NPB6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PARD6AQ9NPB6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PARD6AQ9NPB6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PARD6AQ9NPB6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PARD6AQ9NPB6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PARD6AQ9NPB6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PARD6AQ9NPB6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PARD6AQ9NPB6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PARD6AQ9NPB6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PARD6AQ9NPB6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PARD6AQ9NPB6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PARD6AQ9NPB6 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PARD6AQ9NPB6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PARD6AQ9NPB6 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PARD6AQ9NPB6 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PARD6AQ9NPB6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PARD6AQ9NPB6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PARD6AQ9NPB6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PARD6AQ9NPB6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PARD6AQ9NPB6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PARD6AQ9NPB6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PARD6AQ9NPB6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PARD6AQ9NPB6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PARD6AQ9NPB6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PARD6AQ9NPB6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PARD6AQ9NPB6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PARD6AQ9NPB6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PARD6AQ9NPB6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PARD6AQ9NPB6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PARD6AQ9NPB6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PARD6AQ9NPB6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PARD6AQ9NPB6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PARD6AQ9NPB6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARD6AQ9NPB6 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARD6AQ9NPB6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARD6AQ9NPB6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARD6AQ9NPB6 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARD6AQ9NPB6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PARD6AQ9NPB6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PARD6AQ9NPB6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PARD6AQ9NPB6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PARD6AQ9NPB6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PARD6AQ9NPB6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PARD6AQ9NPB6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PARD6AQ9NPB6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PARD6AQ9NPB6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARD6AQ9NPB6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARD6AQ9NPB6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARD6AQ9NPB6 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARD6AQ9NPB6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARD6AQ9NPB6 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PARD6AQ9NPB6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PARD6AQ9NPB6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARD6AQ9NPB6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARD6AQ9NPB6 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARD6AQ9NPB6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PARD6AQ9NPB6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARD6AQ9NPB6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARD6AQ9NPB6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARD6AQ9NPB6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARD6AQ9NPB6 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARD6AQ9NPB6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARD6AQ9NPB6 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARD6AQ9NPB6 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARD6AQ9NPB6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PARD6AQ9NPB6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARD6AQ9NPB6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARD6AQ9NPB6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PARD6AQ9NPB6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PARD6AQ9NPB6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARD6AQ9NPB6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARD6AQ9NPB6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PARD6AQ9NPB6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARD6AQ9NPB6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARD6AQ9NPB6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARD6AQ9NPB6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARD6AQ9NPB6 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARD6AQ9NPB6 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARD6AQ9NPB6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PARD6AQ9NPB6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARD6AQ9NPB6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARD6AQ9NPB6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PARD6AQ9NPB6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PARD6AQ9NPB6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms