Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX9

VCX3A, Variable charge X-linked protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCX3AQ9NNX9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
VCX3AQ9NNX9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
VCX3AQ9NNX9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
VCX3AQ9NNX9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.2 ms