Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU1

MCOLN1, Mucolipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN1Q9GZU1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MCOLN1Q9GZU1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCOLN1Q9GZU1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MCOLN1Q9GZU1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCOLN1Q9GZU1 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCOLN1Q9GZU1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
MCOLN1Q9GZU1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCOLN1Q9GZU1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCOLN1Q9GZU1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCOLN1Q9GZU1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCOLN1Q9GZU1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCOLN1Q9GZU1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCOLN1Q9GZU1 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCOLN1Q9GZU1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCOLN1Q9GZU1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCOLN1Q9GZU1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCOLN1Q9GZU1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCOLN1Q9GZU1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCOLN1Q9GZU1 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCOLN1Q9GZU1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
MCOLN1Q9GZU1 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCOLN1Q9GZU1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCOLN1Q9GZU1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCOLN1Q9GZU1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCOLN1Q9GZU1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCOLN1Q9GZU1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCOLN1Q9GZU1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCOLN1Q9GZU1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCOLN1Q9GZU1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCOLN1Q9GZU1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCOLN1Q9GZU1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCOLN1Q9GZU1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCOLN1Q9GZU1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCOLN1Q9GZU1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCOLN1Q9GZU1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MCOLN1Q9GZU1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCOLN1Q9GZU1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCOLN1Q9GZU1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCOLN1Q9GZU1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCOLN1Q9GZU1 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
MCOLN1Q9GZU1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCOLN1Q9GZU1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCOLN1Q9GZU1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCOLN1Q9GZU1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCOLN1Q9GZU1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
MCOLN1Q9GZU1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCOLN1Q9GZU1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCOLN1Q9GZU1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCOLN1Q9GZU1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCOLN1Q9GZU1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCOLN1Q9GZU1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCOLN1Q9GZU1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCOLN1Q9GZU1 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MCOLN1Q9GZU1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCOLN1Q9GZU1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCOLN1Q9GZU1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCOLN1Q9GZU1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCOLN1Q9GZU1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCOLN1Q9GZU1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCOLN1Q9GZU1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCOLN1Q9GZU1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCOLN1Q9GZU1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCOLN1Q9GZU1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MCOLN1Q9GZU1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCOLN1Q9GZU1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCOLN1Q9GZU1 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MCOLN1Q9GZU1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCOLN1Q9GZU1 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCOLN1Q9GZU1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MCOLN1Q9GZU1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MCOLN1Q9GZU1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCOLN1Q9GZU1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
MCOLN1Q9GZU1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCOLN1Q9GZU1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MCOLN1Q9GZU1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
MCOLN1Q9GZU1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
MCOLN1Q9GZU1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCOLN1Q9GZU1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCOLN1Q9GZU1 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCOLN1Q9GZU1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCOLN1Q9GZU1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MCOLN1Q9GZU1 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MCOLN1Q9GZU1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MCOLN1Q9GZU1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MCOLN1Q9GZU1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MCOLN1Q9GZU1 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
MCOLN1Q9GZU1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCOLN1Q9GZU1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCOLN1Q9GZU1 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCOLN1Q9GZU1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MCOLN1Q9GZU1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCOLN1Q9GZU1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCOLN1Q9GZU1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCOLN1Q9GZU1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCOLN1Q9GZU1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MCOLN1Q9GZU1 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCOLN1Q9GZU1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCOLN1Q9GZU1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCOLN1Q9GZU1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MCOLN1Q9GZU1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms