Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR6

RTN4R, Reticulon-4 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4RQ9BZR6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RTN4RQ9BZR6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RTN4RQ9BZR6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
RTN4RQ9BZR6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RTN4RQ9BZR6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RTN4RQ9BZR6 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTN4RQ9BZR6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTN4RQ9BZR6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTN4RQ9BZR6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTN4RQ9BZR6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTN4RQ9BZR6 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTN4RQ9BZR6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTN4RQ9BZR6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RTN4RQ9BZR6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTN4RQ9BZR6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTN4RQ9BZR6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTN4RQ9BZR6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTN4RQ9BZR6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTN4RQ9BZR6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RTN4RQ9BZR6 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTN4RQ9BZR6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTN4RQ9BZR6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTN4RQ9BZR6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RTN4RQ9BZR6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms