Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DCLRE1CQ96SD1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DCLRE1CQ96SD1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DCLRE1CQ96SD1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DCLRE1CQ96SD1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCLRE1CQ96SD1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCLRE1CQ96SD1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCLRE1CQ96SD1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCLRE1CQ96SD1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCLRE1CQ96SD1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DCLRE1CQ96SD1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCLRE1CQ96SD1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DCLRE1CQ96SD1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCLRE1CQ96SD1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCLRE1CQ96SD1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DCLRE1CQ96SD1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCLRE1CQ96SD1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
DCLRE1CQ96SD1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCLRE1CQ96SD1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCLRE1CQ96SD1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DCLRE1CQ96SD1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
DCLRE1CQ96SD1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCLRE1CQ96SD1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCLRE1CQ96SD1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCLRE1CQ96SD1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCLRE1CQ96SD1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCLRE1CQ96SD1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCLRE1CQ96SD1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCLRE1CQ96SD1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DCLRE1CQ96SD1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCLRE1CQ96SD1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCLRE1CQ96SD1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCLRE1CQ96SD1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DCLRE1CQ96SD1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCLRE1CQ96SD1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCLRE1CQ96SD1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCLRE1CQ96SD1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCLRE1CQ96SD1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCLRE1CQ96SD1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCLRE1CQ96SD1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCLRE1CQ96SD1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DCLRE1CQ96SD1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCLRE1CQ96SD1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCLRE1CQ96SD1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCLRE1CQ96SD1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCLRE1CQ96SD1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCLRE1CQ96SD1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCLRE1CQ96SD1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCLRE1CQ96SD1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
DCLRE1CQ96SD1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
DCLRE1CQ96SD1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms