Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF12Q96QT6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF12Q96QT6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF12Q96QT6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF12Q96QT6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PHF12Q96QT6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF12Q96QT6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF12Q96QT6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF12Q96QT6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF12Q96QT6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF12Q96QT6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF12Q96QT6 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF12Q96QT6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF12Q96QT6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHF12Q96QT6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF12Q96QT6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF12Q96QT6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF12Q96QT6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF12Q96QT6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF12Q96QT6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF12Q96QT6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHF12Q96QT6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHF12Q96QT6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF12Q96QT6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF12Q96QT6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF12Q96QT6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHF12Q96QT6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF12Q96QT6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF12Q96QT6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF12Q96QT6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF12Q96QT6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF12Q96QT6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHF12Q96QT6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF12Q96QT6 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF12Q96QT6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF12Q96QT6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF12Q96QT6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF12Q96QT6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHF12Q96QT6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF12Q96QT6 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF12Q96QT6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF12Q96QT6 Z99916.3-201ENST00000623422 1080 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF12Q96QT6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF12Q96QT6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PHF12Q96QT6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF12Q96QT6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF12Q96QT6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF12Q96QT6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF12Q96QT6 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF12Q96QT6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF12Q96QT6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF12Q96QT6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF12Q96QT6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHF12Q96QT6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF12Q96QT6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF12Q96QT6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF12Q96QT6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF12Q96QT6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF12Q96QT6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF12Q96QT6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF12Q96QT6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF12Q96QT6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF12Q96QT6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHF12Q96QT6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF12Q96QT6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF12Q96QT6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF12Q96QT6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF12Q96QT6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PHF12Q96QT6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PHF12Q96QT6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms