Protein–RNA interactions for Protein: Q96JC4

ZNF479, Zinc finger protein 479, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF479Q96JC4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZNF479Q96JC4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF479Q96JC4 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF479Q96JC4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF479Q96JC4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF479Q96JC4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF479Q96JC4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF479Q96JC4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF479Q96JC4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZNF479Q96JC4 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF479Q96JC4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF479Q96JC4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF479Q96JC4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF479Q96JC4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF479Q96JC4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF479Q96JC4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF479Q96JC4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF479Q96JC4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF479Q96JC4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF479Q96JC4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF479Q96JC4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZNF479Q96JC4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF479Q96JC4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF479Q96JC4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF479Q96JC4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF479Q96JC4 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF479Q96JC4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF479Q96JC4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ZNF479Q96JC4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF479Q96JC4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF479Q96JC4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF479Q96JC4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF479Q96JC4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ZNF479Q96JC4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF479Q96JC4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF479Q96JC4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF479Q96JC4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF479Q96JC4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF479Q96JC4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF479Q96JC4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ZNF479Q96JC4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF479Q96JC4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF479Q96JC4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF479Q96JC4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ZNF479Q96JC4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF479Q96JC4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF479Q96JC4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF479Q96JC4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF479Q96JC4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF479Q96JC4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ZNF479Q96JC4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ZNF479Q96JC4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms