Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ANKRD53Q8N9V6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ANKRD53Q8N9V6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ANKRD53Q8N9V6 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD53Q8N9V6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD53Q8N9V6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD53Q8N9V6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD53Q8N9V6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD53Q8N9V6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD53Q8N9V6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD53Q8N9V6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD53Q8N9V6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD53Q8N9V6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD53Q8N9V6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ANKRD53Q8N9V6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ANKRD53Q8N9V6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ANKRD53Q8N9V6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ANKRD53Q8N9V6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ANKRD53Q8N9V6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ANKRD53Q8N9V6 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ANKRD53Q8N9V6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ANKRD53Q8N9V6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ANKRD53Q8N9V6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD53Q8N9V6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD53Q8N9V6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD53Q8N9V6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD53Q8N9V6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD53Q8N9V6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD53Q8N9V6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ANKRD53Q8N9V6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD53Q8N9V6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD53Q8N9V6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD53Q8N9V6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD53Q8N9V6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD53Q8N9V6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD53Q8N9V6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD53Q8N9V6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD53Q8N9V6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD53Q8N9V6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD53Q8N9V6 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD53Q8N9V6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD53Q8N9V6 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD53Q8N9V6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ANKRD53Q8N9V6 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD53Q8N9V6 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ANKRD53Q8N9V6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms