Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM78BQ5VT40 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FAM78BQ5VT40 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM78BQ5VT40 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM78BQ5VT40 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM78BQ5VT40 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM78BQ5VT40 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM78BQ5VT40 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM78BQ5VT40 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM78BQ5VT40 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM78BQ5VT40 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM78BQ5VT40 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM78BQ5VT40 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM78BQ5VT40 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM78BQ5VT40 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM78BQ5VT40 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FAM78BQ5VT40 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM78BQ5VT40 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM78BQ5VT40 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM78BQ5VT40 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM78BQ5VT40 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
FAM78BQ5VT40 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM78BQ5VT40 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM78BQ5VT40 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM78BQ5VT40 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM78BQ5VT40 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM78BQ5VT40 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM78BQ5VT40 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM78BQ5VT40 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM78BQ5VT40 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM78BQ5VT40 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM78BQ5VT40 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM78BQ5VT40 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FAM78BQ5VT40 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM78BQ5VT40 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM78BQ5VT40 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM78BQ5VT40 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM78BQ5VT40 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM78BQ5VT40 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM78BQ5VT40 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
FAM78BQ5VT40 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM78BQ5VT40 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM78BQ5VT40 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM78BQ5VT40 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM78BQ5VT40 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM78BQ5VT40 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM78BQ5VT40 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
FAM78BQ5VT40 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
FAM78BQ5VT40 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms