Protein–RNA interactions for Protein: Q53H54

TRMT12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT12Q53H54 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRMT12Q53H54 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMT12Q53H54 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT12Q53H54 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT12Q53H54 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRMT12Q53H54 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRMT12Q53H54 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRMT12Q53H54 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRMT12Q53H54 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRMT12Q53H54 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TRMT12Q53H54 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRMT12Q53H54 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRMT12Q53H54 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRMT12Q53H54 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRMT12Q53H54 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRMT12Q53H54 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRMT12Q53H54 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRMT12Q53H54 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRMT12Q53H54 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRMT12Q53H54 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRMT12Q53H54 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRMT12Q53H54 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRMT12Q53H54 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRMT12Q53H54 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRMT12Q53H54 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRMT12Q53H54 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRMT12Q53H54 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRMT12Q53H54 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRMT12Q53H54 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRMT12Q53H54 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRMT12Q53H54 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRMT12Q53H54 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRMT12Q53H54 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRMT12Q53H54 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRMT12Q53H54 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRMT12Q53H54 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRMT12Q53H54 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRMT12Q53H54 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRMT12Q53H54 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRMT12Q53H54 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRMT12Q53H54 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRMT12Q53H54 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRMT12Q53H54 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRMT12Q53H54 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TRMT12Q53H54 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms